More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1547 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  86.44 
 
 
614 aa  1081    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.3 
 
 
614 aa  983    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
613 aa  1238    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0444  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.73 
 
 
613 aa  600  1e-170  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0364501  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
639 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
639 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 
639 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
640 aa  430  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
641 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
620 aa  403  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.3 
 
 
729 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.51 
 
 
729 aa  302  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000025801 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 
729 aa  290  6e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0298102 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.61 
 
 
729 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 
731 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.395516  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.95 
 
 
730 aa  233  9e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.292082  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 
732 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.04 
 
 
731 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 
421 aa  213  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 
731 aa  207  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.723997  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
519 aa  205  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0842  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.81 
 
 
732 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1096  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 
730 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 
731 aa  196  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00776306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
493 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
633 aa  183  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
835 aa  183  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
631 aa  179  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
503 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
1043 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
646 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
412 aa  177  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
412 aa  177  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  37.01 
 
 
461 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  36.61 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.66 
 
 
732 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  36.61 
 
 
461 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.53 
 
 
463 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
473 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
723 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  29.94 
 
 
508 aa  171  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  34.25 
 
 
464 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  29.86 
 
 
455 aa  170  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  29.86 
 
 
455 aa  170  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  31.06 
 
 
1133 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
473 aa  169  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  31.23 
 
 
560 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  27.31 
 
 
1207 aa  168  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
467 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  28.73 
 
 
620 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 
953 aa  167  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
382 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  31.23 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  37.71 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
456 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
799 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  28.42 
 
 
1130 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  29.86 
 
 
458 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
612 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  29.86 
 
 
458 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
1207 aa  165  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
607 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
396 aa  165  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  30.14 
 
 
458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 
671 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.05 
 
 
1021 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 
933 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0312  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
556 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1247  multisensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
607 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000186928  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
1119 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 
827 aa  163  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
457 aa  163  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
505 aa  163  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  31.46 
 
 
927 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
1010 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
463 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
524 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  28.79 
 
 
593 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  29.3 
 
 
458 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  29.58 
 
 
458 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  29.58 
 
 
458 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 
691 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
383 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
487 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
932 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
432 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000747291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
391 aa  161  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.88 
 
 
1629 aa  161  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
815 aa  161  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
459 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.97 
 
 
458 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
452 aa  160  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  29.3 
 
 
458 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
468 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>