254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1494 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  89.04 
 
 		 365 aa  676    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  100 
 
 		 374 aa  764    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  91.42 
 
 		 373 aa  714    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  88.77 
 
 		 374 aa  700    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  55.85 
 
 		 372 aa  421  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  54.72 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  55.8 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  53.91 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  50.54 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  49.28 
 
 		 358 aa  345  8e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  49.86 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  42.67 
 
 		 374 aa  328  7e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  44.92 
 
 		 369 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  43.62 
 
 		 378 aa  323  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  42.97 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  41.28 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  42.34 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  40 
 
 		 369 aa  279  7e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  40.27 
 
 		 370 aa  275  8e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  41.26 
 
 		 373 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  39.89 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  37.93 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  40.11 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  37.63 
 
 		 375 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  40.94 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  37.56 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  40.72 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  38.76 
 
 		 409 aa  247  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  39.08 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  37.14 
 
 		 375 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  38.89 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  37.4 
 
 		 386 aa  242  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  39.37 
 
 		 384 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  39.55 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  37.37 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  38.83 
 
 		 689 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  36.6 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  37.99 
 
 		 688 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  38.05 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  36.31 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  35.31 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  35.81 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  39.15 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  33.52 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  37.46 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  36.31 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  34.68 
 
 		 366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  34.75 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  32.94 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  30.72 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  28.08 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.59 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 334 aa  99.8  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 354 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  27.51 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  27.02 
 
 		 362 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  24.47 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1174  iron ABC transporter, solute-binding protein  24.88 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  25.85 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25.73 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.94 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  26.85 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.46 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  26.12 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.75 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.17 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.61 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  24.61 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.61 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  22.65 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  25 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  23.33 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.09 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  23.93 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  22.5 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1479  iron(III) dicitrate-biding protein  23.48 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  21.34 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  23.35 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  23.78 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  23.25 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  23.62 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  22.6 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  24.52 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  22.51 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  24.33 
 
 		 419 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>