More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1448 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  84.25 
 
 		 254 aa  447  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  77.73 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 253 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 		 252 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  32.31 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.92 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.85 
 
 		 513 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  31.44 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.38 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  31.15 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  25.79 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  25.4 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  33.78 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  28.5 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28.06 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  28.24 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  28.24 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  28.63 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  28.24 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  27.84 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  27.84 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  30 
 
 		 285 aa  99.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.36 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.36 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.36 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.36 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  30.49 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.36 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.36 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.36 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.63 
 
 		 266 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  28.79 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.48 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.4 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  28 
 
 		 258 aa  95.5  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.13 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  25.9 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.4 
 
 		 266 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 285 aa  95.1  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  28.02 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.76 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.76 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  28.02 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  28.02 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.17 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>