250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1447 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 392 aa  789    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  91.69 
 
 		 385 aa  724    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  91.45 
 
 		 386 aa  721    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  75.26 
 
 		 391 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  57.4 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  33.16 
 
 		 399 aa  209  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  30.23 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  34.26 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  31.49 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  31.87 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  30.85 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  28.91 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  31.78 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  31.23 
 
 		 388 aa  162  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  29.95 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  30.26 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 385 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.72 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.65 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.37 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 407 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  26.44 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  23.78 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 393 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  22.28 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  21.28 
 
 		 381 aa  92.8  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  23.06 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  24.15 
 
 		 361 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  26.43 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.25 
 
 		 393 aa  86.3  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  24.75 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  22.98 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.25 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.49 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  21.75 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  23.7 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  23.86 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  21.78 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  23.45 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  22.94 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  26.21 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.05 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  22.52 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  23.2 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.47 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.47 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  23.31 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  20.31 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.97 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  24.55 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  22.63 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  22.6 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  22.6 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  23.78 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  23.89 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.89 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  21.94 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  19.74 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  21.39 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.68 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  22.9 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  24.24 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  24.82 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  21.98 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  27.54 
 
 		 368 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  22.8 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  23.36 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.4 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  21.84 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>