More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1398 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  97.83 
 
 
184 aa  374  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  96.74 
 
 
184 aa  371  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  86.96 
 
 
184 aa  340  5.999999999999999e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  72.28 
 
 
184 aa  285  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  67.39 
 
 
184 aa  273  9e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  67.93 
 
 
182 aa  261  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  63.04 
 
 
184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  56.52 
 
 
184 aa  221  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  54.89 
 
 
183 aa  214  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  40.44 
 
 
184 aa  161  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  43.02 
 
 
186 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  41.01 
 
 
188 aa  153  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 
182 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  40.45 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  40.45 
 
 
186 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17340  cupin domain-containing protein  38.25 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224659  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1702  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  35.83 
 
 
193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  36.51 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  35.48 
 
 
200 aa  107  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  28.42 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
192 aa  85.1  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  29.12 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  25.53 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  25.54 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  27.57 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  26.99 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  29.53 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  28.12 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  27.84 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  27.47 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  28.11 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  25.65 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  29.03 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  26.18 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  25.91 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.09 
 
 
503 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  25.56 
 
 
209 aa  64.3  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  26.23 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  25.67 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  26.49 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  30.88 
 
 
503 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5833  transcriptional regulator, XRE family  27.06 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  27.47 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 
196 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  27.27 
 
 
212 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  25.44 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  25.44 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4562  transcriptional regulator, XRE family  26.9 
 
 
173 aa  61.6  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 
201 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  23.86 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 
224 aa  61.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  24.72 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  23.86 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  23.98 
 
 
199 aa  61.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  23.86 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  23.86 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  23.86 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  25.41 
 
 
189 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  26.78 
 
 
201 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  23.86 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.19 
 
 
189 aa  61.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  25 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  27.47 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  26.63 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  24.71 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  23.73 
 
 
211 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  26.63 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  24.43 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4528  transcriptional regulator, XRE family  25.88 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  23.3 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  24.43 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  23.98 
 
 
199 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  24.43 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  23.86 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  27.72 
 
 
227 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 
227 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  23.86 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>