27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1369 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  939    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  93.78 
 
 
467 aa  884    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  93.13 
 
 
467 aa  888    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  68.95 
 
 
468 aa  657    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  53.91 
 
 
501 aa  528  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  27.44 
 
 
379 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  24.29 
 
 
400 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  23.73 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  22.96 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  23.06 
 
 
401 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  24.74 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  24.3 
 
 
396 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  20.26 
 
 
387 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  23.9 
 
 
396 aa  60.1  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  26.39 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  26.52 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  22.18 
 
 
383 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  23.1 
 
 
416 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  38.57 
 
 
382 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  24.38 
 
 
406 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  25.75 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  20.43 
 
 
386 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  23.29 
 
 
402 aa  47  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  19.15 
 
 
390 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  18.87 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  23.66 
 
 
427 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  23.25 
 
 
405 aa  43.9  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>