More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1199 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1780  isoleucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
1053 aa  755    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0700208  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1055  isoleucyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
1089 aa  659    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0633304  normal  0.357924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
1068 aa  695    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0784  isoleucyl-tRNA synthetase  83.56 
 
 
1033 aa  1797    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3613  isoleucyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
1058 aa  801    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0104  isoleucyl-tRNA synthetase  97 
 
 
1034 aa  2040    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0606  isoleucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
1062 aa  813    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.63379  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0154  isoleucyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
1024 aa  645    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0185  isoleucyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
1058 aa  820    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.232804  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0152  isoleucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
1060 aa  781    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0198182 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0719  isoleucyl-tRNA synthetase  96.23 
 
 
1034 aa  2028    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.280166 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0945  isoleucyl-tRNA synthetase  68.46 
 
 
1040 aa  1518    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1199  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
1034 aa  2125    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.847726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1825  isoleucyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
1068 aa  672    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
1066 aa  721    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00020204  hitchhiker  0.0000151931 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
1049 aa  882    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0130  isoleucyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
1062 aa  772    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.15677  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2269  isoleucyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 
1076 aa  815    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.585384  normal  0.126832 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0887  isoleucyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
1050 aa  693    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0403  isoleucyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
1059 aa  790    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.171836  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1744  isoleucyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
1070 aa  697    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
1066 aa  784    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2865  isoleucyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
1039 aa  622  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2550  isoleucyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
1039 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1429  isoleucyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
975 aa  602  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2916  isoleucyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 
1059 aa  595  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00208386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1416  isoleucyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
1050 aa  589  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.14603 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
977 aa  587  1e-166  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5846  isoleucyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
1049 aa  582  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856436  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2880  isoleucyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
1054 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.648909  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2428  isoleucyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
1068 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
977 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2374  isoleucyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 
1046 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.59228  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
977 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2663  isoleucyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
1100 aa  572  1e-161  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1977  isoleucyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 
1033 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2971  isoleucyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
1061 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0600156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2241  isoleucyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
1033 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.814784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2027  isoleucyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
1033 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2323  isoleucyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 
1033 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00762761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2181  isoleucyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
1033 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
980 aa  567  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2186  isoleucyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
1033 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.330623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1995  isoleucyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
1033 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2201  isoleucyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
1033 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000414459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2048  isoleucyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
1077 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3131  isoleucyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
1033 aa  561  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0622946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3832  isoleucyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
1091 aa  561  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 
1037 aa  558  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 
1049 aa  558  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 
1060 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.774761  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
1042 aa  553  1e-156  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2014  isoleucyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 
1033 aa  555  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.987236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0322  isoleucyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 
1079 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204908  normal  0.140126 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1773  isoleucyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
1084 aa  549  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0211467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2287  isoleucyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
1085 aa  551  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00241936  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1197  isoleucyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
991 aa  551  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000165985  hitchhiker  0.0000378196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0727  isoleucyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 
1069 aa  549  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.3975  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1991  isoleucyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
1086 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.670114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 
1066 aa  540  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1887  isoleucyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
1080 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0011361  decreased coverage  0.00457118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0423  isoleucyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
1089 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.844237  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0436  isoleucyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 
1108 aa  531  1e-149  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.31942 
 
 
-
 
NC_002936  DET1038  isoleucyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
1014 aa  529  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0523  isoleucyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
1083 aa  532  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.750565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1424  isoleucyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
1069 aa  533  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292782  normal  0.0637422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1029  isoleucyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 
1048 aa  532  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101306  decreased coverage  0.00249031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3676  isoleucyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 
1110 aa  526  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 
1031 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_908  isoleucyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
1014 aa  528  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0001157  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0592  isoleucyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
1135 aa  524  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1709  isoleucyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 
1080 aa  522  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000389774  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0907  isoleucyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
1066 aa  523  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236278  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4830  isoleucyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 
1075 aa  520  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00601966  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02490  isoleucyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 
1134 aa  516  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55429  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0920  isoleucyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 
1014 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000204285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5739  isoleucyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 
1073 aa  519  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155547  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0420  isoleucyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
1129 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.140403 
 
 
-
 
NC_002620  TC0288  isoleucyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 
1036 aa  504  1e-141  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1101  isoleucyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 
1091 aa  504  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288529  normal  0.0200655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0704  isoleucyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
1133 aa  506  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5088  isoleucyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
1081 aa  505  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00024165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4041  isoleucyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
922 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00112426  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2036  isoleucyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 
1091 aa  503  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00485775  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1360  isoleucyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 
1093 aa  502  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0502657  normal  0.211718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0044  isoleucyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 
1148 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_002950  PG1596  isoleucyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 
1137 aa  499  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09270  isoleucyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
929 aa  498  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.157511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3853  isoleucyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 
1056 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00150354  decreased coverage  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4664  isoleucyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 
1143 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0311577  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3252  isoleucyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 
1051 aa  496  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 
927 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
931 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
1065 aa  491  1e-137  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439306 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83229  isoleucyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 
1082 aa  487  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0118016  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 
931 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
913 aa  483  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1320  Isoleucyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
926 aa  478  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5753  isoleucyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
1037 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1855  isoleucyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 
929 aa  475  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.552413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>