14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1181 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0084  S-layer protein  97.76 
 
 
447 aa  837    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0737  hypothetical protein  90.83 
 
 
447 aa  785    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.854836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1181  S-layer family protein  100 
 
 
447 aa  879    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0802  S-layer protein  67.56 
 
 
444 aa  619  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.648701  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  38.28 
 
 
437 aa  276  5e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  38.55 
 
 
976 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  43.06 
 
 
712 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  34.23 
 
 
718 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0165  hypothetical protein  35.96 
 
 
312 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00021132  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  36.11 
 
 
424 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  23.96 
 
 
531 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0135  hypothetical protein  40 
 
 
754 aa  50.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0602047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  33.82 
 
 
1336 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  31.94 
 
 
561 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>