158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1173 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  100 
 
 
163 aa  323  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  92.64 
 
 
163 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  91.41 
 
 
163 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  76.83 
 
 
164 aa  263  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  56.97 
 
 
168 aa  191  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.36 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  33.74 
 
 
181 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.95 
 
 
165 aa  97.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  35.93 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.54 
 
 
164 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  33.33 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  30.72 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.38 
 
 
210 aa  82  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  31.33 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  31.14 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.15 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  29.81 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  29.81 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  29.45 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  29.19 
 
 
172 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.13 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.56 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.74 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  31.9 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.56 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.22 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.54 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  31.9 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.86 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  30.41 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  29.34 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  30.67 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1112  phosphodiesterase  35.51 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.279035  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  29.7 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.43 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.17 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17936  predicted protein  28.57 
 
 
206 aa  67.4  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.572241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.61 
 
 
170 aa  67  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.4 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  28.99 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  29.63 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.2 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  31.9 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.75 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  28.48 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  27.78 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  31.14 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.82 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.44 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.52 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31.21 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  24.73 
 
 
195 aa  61.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.78 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  29.08 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.32 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.48 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.93 
 
 
175 aa  58.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  30.41 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.76 
 
 
178 aa  57.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  26.88 
 
 
188 aa  57.8  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  28.28 
 
 
154 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  27.39 
 
 
168 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.9 
 
 
180 aa  57.4  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  28.09 
 
 
188 aa  57.4  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  29.01 
 
 
185 aa  57.4  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  25.93 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.79 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  33.11 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  25 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.87 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01341  vacuolar protein sorting 29, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09480)  28.47 
 
 
200 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0461116  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  31.52 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  28.81 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  24.36 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  24.36 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  24.36 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.19 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  24.36 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  29.94 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  24.36 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  27.22 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.08 
 
 
186 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  24.36 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  27.49 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01710  retrograde transport, endosome to Golgi-related protein, putative  28.57 
 
 
203 aa  54.7  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  24.36 
 
 
167 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  24.36 
 
 
167 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  28.03 
 
 
167 aa  53.9  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  32.65 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  25 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  32.65 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.81 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.15 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  31.54 
 
 
171 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.79 
 
 
163 aa  51.2  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  34.46 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>