19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1166 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1166  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  204  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.093445  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0069  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  204  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.512447  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0752  hypothetical protein  97.03 
 
 
101 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0695034  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0818  hypothetical protein  88.12 
 
 
101 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0272  hypothetical protein  74 
 
 
109 aa  157  6e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000195295  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1386  Protein of unknown function DUF357  51.02 
 
 
97 aa  102  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.151308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0959  Protein of unknown function DUF357  40.45 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2901  hypothetical protein  38.89 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.776185  hitchhiker  0.000281403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0969  hypothetical protein  41.76 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00420162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2439  Protein of unknown function DUF357  38.24 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0783  Protein of unknown function DUF357  38.24 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.332797  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2413  Protein of unknown function DUF357  39.71 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.263584 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0553  Protein of unknown function DUF357  38.2 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0387  hypothetical protein  47.17 
 
 
186 aa  57.4  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0910313  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1782  hypothetical protein  33.77 
 
 
189 aa  54.3  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0117  Protein of unknown function DUF357  40.68 
 
 
187 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0789  hypothetical protein  41.18 
 
 
191 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129497  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2069  hypothetical protein  25.56 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.792812  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1112  hypothetical protein  38.3 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>