More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1157 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  62.81 
 
 		 551 aa  642    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  94.07 
 
 		 543 aa  982    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  62.74 
 
 		 552 aa  638    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  61.54 
 
 		 542 aa  640    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  62.93 
 
 		 551 aa  640    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  97.8 
 
 		 545 aa  1054    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  100 
 
 		 542 aa  1074    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  61.39 
 
 		 543 aa  644    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  98.89 
 
 		 542 aa  1064    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  78.63 
 
 		 543 aa  838    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  60.04 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  62.84 
 
 		 552 aa  629  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  60.57 
 
 		 553 aa  620  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  60.35 
 
 		 551 aa  614  9.999999999999999e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  58.45 
 
 		 557 aa  608  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  57.75 
 
 		 558 aa  608  1e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  56.57 
 
 		 543 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  60.23 
 
 		 539 aa  604  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  56.4 
 
 		 559 aa  598  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  57.42 
 
 		 563 aa  593  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  59.02 
 
 		 558 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  57.39 
 
 		 547 aa  566  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  54.35 
 
 		 570 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  54.56 
 
 		 553 aa  556  1e-157  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  53.59 
 
 		 560 aa  552  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  55.2 
 
 		 500 aa  548  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  53.46 
 
 		 552 aa  545  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  51.24 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  51.89 
 
 		 554 aa  541  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  51.15 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  52.57 
 
 		 561 aa  531  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  53.01 
 
 		 548 aa  526  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  50.49 
 
 		 553 aa  526  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  51.17 
 
 		 540 aa  525  1e-148  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  54.68 
 
 		 541 aa  521  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  50.97 
 
 		 545 aa  522  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  52.32 
 
 		 549 aa  511  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  53.2 
 
 		 554 aa  511  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  49.01 
 
 		 559 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.19 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.46 
 
 		 527 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  51.84 
 
 		 550 aa  502  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  50.19 
 
 		 548 aa  497  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  49.5 
 
 		 547 aa  491  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.37 
 
 		 532 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.56 
 
 		 555 aa  491  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.19 
 
 		 529 aa  491  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  49.25 
 
 		 562 aa  488  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.23 
 
 		 536 aa  485  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  49.9 
 
 		 554 aa  474  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  49.71 
 
 		 558 aa  474  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  49.32 
 
 		 560 aa  474  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.86 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  45.23 
 
 		 558 aa  468  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  49.13 
 
 		 553 aa  464  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  47.08 
 
 		 528 aa  444  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.53 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.89 
 
 		 525 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.93 
 
 		 519 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.05 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  45 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  41.09 
 
 		 535 aa  390  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  38.67 
 
 		 538 aa  376  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  40.98 
 
 		 536 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  40.08 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  36.78 
 
 		 527 aa  364  2e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  40 
 
 		 541 aa  364  3e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  38.34 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  38.34 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  37.25 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  38.51 
 
 		 548 aa  354  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  38.07 
 
 		 542 aa  355  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  34.93 
 
 		 567 aa  351  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  40 
 
 		 535 aa  350  4e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  39.96 
 
 		 548 aa  343  5e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  35.59 
 
 		 570 aa  341  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  37.76 
 
 		 527 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.38 
 
 		 529 aa  337  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  35.57 
 
 		 536 aa  330  4e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  35.62 
 
 		 553 aa  326  6e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  36.72 
 
 		 551 aa  325  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  36.83 
 
 		 533 aa  325  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  34.89 
 
 		 560 aa  320  5e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  35.91 
 
 		 542 aa  319  7e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  36.31 
 
 		 577 aa  319  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  36.35 
 
 		 563 aa  317  4e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  35.88 
 
 		 558 aa  316  8e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  35.01 
 
 		 568 aa  313  5.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  36.15 
 
 		 530 aa  306  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  35.47 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.71 
 
 		 531 aa  290  5.0000000000000004e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  31.04 
 
 		 549 aa  272  9e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  33.65 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.01 
 
 		 523 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  35.63 
 
 		 527 aa  271  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  31.94 
 
 		 558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  30.84 
 
 		 547 aa  266  5.999999999999999e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  32.08 
 
 		 541 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  33.86 
 
 		 526 aa  258  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  31.36 
 
 		 546 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>