More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1152 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  100 
 
 
312 aa  630  1e-180  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  94.23 
 
 
312 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0766  ABC transporter related  91.35 
 
 
312 aa  567  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.812823  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  72.61 
 
 
314 aa  474  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  40.06 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  40.81 
 
 
348 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  46 
 
 
347 aa  225  9e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  48.92 
 
 
355 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  35.5 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.21 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0974  ABC transporter related  36.22 
 
 
328 aa  211  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0227339  unclonable  0.000000000000144331 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
368 aa  210  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  43.51 
 
 
335 aa  209  6e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.42 
 
 
402 aa  207  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  42.48 
 
 
368 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  35.91 
 
 
334 aa  206  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  44.59 
 
 
367 aa  206  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  44.59 
 
 
367 aa  206  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  43.97 
 
 
370 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  36.6 
 
 
342 aa  204  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  42.8 
 
 
358 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2123  ABC transporter related  43.58 
 
 
542 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  45.16 
 
 
355 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  34.98 
 
 
328 aa  202  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  45.45 
 
 
356 aa  202  7e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  45.16 
 
 
355 aa  202  9e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2228  ABC transporter related  43.59 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0571204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  40.29 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  33.43 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  39.78 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  37.2 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  40.87 
 
 
370 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  40 
 
 
319 aa  200  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  37.2 
 
 
346 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
380 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  40.95 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  41.81 
 
 
383 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  47.12 
 
 
359 aa  199  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.25 
 
 
353 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 
336 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  42.44 
 
 
353 aa  198  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  36.16 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.64 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1525  ABC transporter related  46.55 
 
 
367 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.571493  hitchhiker  0.00153278 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  42.44 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  40.6 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  34.29 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  35.48 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  41.53 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  42.73 
 
 
369 aa  196  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1447  ABC transporter related  46.55 
 
 
367 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5307  ABC transporter related  31.29 
 
 
355 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.853728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  42.49 
 
 
372 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2005  ABC transporter related  40.37 
 
 
378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833855  normal  0.0467613 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  43.97 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  42.02 
 
 
353 aa  195  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 
370 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  41.32 
 
 
342 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  36.07 
 
 
356 aa  195  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  38.33 
 
 
333 aa  195  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  35.61 
 
 
367 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  39.66 
 
 
384 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  36.76 
 
 
367 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 
373 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  39.66 
 
 
379 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  35.88 
 
 
333 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  40.52 
 
 
353 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 
362 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
340 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 
331 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 
333 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4396  ABC transporter related  32.45 
 
 
370 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.625138  normal  0.658591 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  39.22 
 
 
372 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.68 
 
 
331 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 
333 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  38.85 
 
 
330 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 
366 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 
372 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  42.74 
 
 
381 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2630  ABC transporter related  40.83 
 
 
378 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0792503  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1299  ABC transporter related protein  41.87 
 
 
394 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0956135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  41.45 
 
 
386 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  35.29 
 
 
324 aa  192  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  39.55 
 
 
351 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.45 
 
 
386 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 
333 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  39.66 
 
 
356 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  39.31 
 
 
357 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  38.03 
 
 
399 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.34 
 
 
355 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.05 
 
 
366 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0754  ABC transporter related  41.81 
 
 
363 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  42.48 
 
 
356 aa  192  8e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4279  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.51 
 
 
372 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.714289  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
382 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0387  ABC transporter related  45.69 
 
 
367 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  39.18 
 
 
351 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 
357 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>