More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1150 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1150  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.922491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0055  hydrogenase accessory protein HypB  97.32 
 
 		 224 aa  434  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0768  hydrogenase accessory protein HypB  96.43 
 
 		 224 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0833  hydrogenase accessory protein HypB  86.16 
 
 		 227 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1020  hydrogenase accessory protein HypB  74.54 
 
 		 220 aa  331  5e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  51.12 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1515  hypothetical protein  51.42 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.890478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2484  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0335  hydrogenase accessory protein HypB  49.07 
 
 		 215 aa  203  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.734472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0470  hydrogenase accessory protein HypB  49.07 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2308  hydrogenase accessory protein HypB  48.6 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  40.95 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  41.04 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  37.21 
 
 		 326 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  37.98 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  37.44 
 
 		 294 aa  168  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  38.28 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  38.29 
 
 		 283 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  39.25 
 
 		 286 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2335  hydrogenase accessory protein HypB  46.83 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  38.54 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  37.96 
 
 		 321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  37.21 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  38.07 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  37.62 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  39.52 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  42.08 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  39.52 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  36.99 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.1 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  40.49 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  33.66 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  38.99 
 
 		 279 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  34.29 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  39.44 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  36.76 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  39.9 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  34.11 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  35.71 
 
 		 352 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  40.1 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  39.61 
 
 		 253 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  38.89 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  37.96 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  37.04 
 
 		 284 aa  158  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  37.32 
 
 		 300 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  39.11 
 
 		 295 aa  156  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  39.07 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  40.95 
 
 		 318 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  35.78 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  35.81 
 
 		 292 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  39.05 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  37.56 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  38.07 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  39.22 
 
 		 268 aa  154  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  36.27 
 
 		 268 aa  154  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  38.07 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  38.97 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  38.39 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  38.97 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  37.75 
 
 		 296 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2018  hydrogenase accessory protein HypB  35.27 
 
 		 315 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  38.97 
 
 		 285 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.89 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.89 
 
 		 290 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.89 
 
 		 290 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  36.14 
 
 		 303 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.89 
 
 		 290 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.89 
 
 		 290 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  35.29 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  35.89 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  35.89 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.89 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  35.89 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.89 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  38.07 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.89 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.89 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  36.87 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  38.97 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  38.28 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  37.07 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  37.44 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0534  hydrogenase accessory protein HypB  37.05 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  38.28 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  34.25 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.16 
 
 		 252 aa  151  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  39.11 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  33.33 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.89 
 
 		 290 aa  151  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  36.02 
 
 		 323 aa  151  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  39.15 
 
 		 407 aa  151  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  34.93 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  35.55 
 
 		 322 aa  151  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  37.2 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  34.93 
 
 		 305 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  35.89 
 
 		 313 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  41.27 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>