More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1139 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  100 
 
 		 327 aa  665    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  96.33 
 
 		 327 aa  624  1e-178  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  97.21 
 
 		 323 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  82.04 
 
 		 323 aa  537  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  68.21 
 
 		 324 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  46.58 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  46.89 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  43.83 
 
 		 330 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  44.38 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  44.27 
 
 		 321 aa  295  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  43.65 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  42.19 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  39.88 
 
 		 333 aa  275  8e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  33.13 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  32.22 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  32.41 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  31.96 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  31.1 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  30.94 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  33.64 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  31.78 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  30.25 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  30.06 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  29.75 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  29.14 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  29.82 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  30.37 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  30.43 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  27.99 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 		 479 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  30.8 
 
 		 486 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  30.08 
 
 		 481 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  28.94 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  25.32 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  30.67 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  25.75 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  26.09 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  25.31 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  25.33 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  25.66 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  25.33 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  26.84 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  25.24 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  26.19 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  27.1 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  26.05 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  24.62 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  25.41 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  25.66 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  25.33 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  25.33 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  25.33 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  26.64 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  23.86 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  23.66 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  23.66 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  23.2 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  23.66 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  23.66 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  27.57 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  28.31 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  24.07 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  25.26 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  26.73 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  26.58 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  27 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  23.57 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  25.91 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  27.76 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  25.91 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  25 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  25.99 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  25.91 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  25.24 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  25.79 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  25.7 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  24.25 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  25.98 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  26.29 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  24.14 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  25.45 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  26.1 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  28.72 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  27.07 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  22.34 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  25.89 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  23.93 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  22.44 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  22.44 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  27.59 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  24.7 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  25 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  26.03 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.79 
 
 		 717 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  24.66 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  23.64 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  27.38 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  25.38 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  25.11 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  22.26 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>