35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1136 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1136  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  363  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0782  nucleotide kinase  90.61 
 
 
181 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0041  hypothetical protein  88.81 
 
 
143 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.481062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0847  hypothetical protein  64.64 
 
 
183 aa  217  7e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0493  hypothetical protein  47.33 
 
 
165 aa  137  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.443376  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0444  hypothetical protein  34.05 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0258  hypothetical protein  37.43 
 
 
182 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.614825  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1343  nucleotide kinase  29.71 
 
 
180 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1127  hypothetical protein  33.52 
 
 
170 aa  101  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2136  hypothetical protein  32.37 
 
 
170 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2367  hypothetical protein  38.12 
 
 
190 aa  99.4  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0066  hypothetical protein  34.68 
 
 
170 aa  99  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2524  hypothetical protein  31.43 
 
 
170 aa  98.2  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.621583  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1227  Adenylate kinase  33.52 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.639738  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0606  Adenylate kinase  28.05 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.828115  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2374  nucleotide kinase  30.07 
 
 
168 aa  88.6  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1903  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1439  Adenylate kinase  36.52 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0366  nucleotide kinase  27.46 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1901  Adenylate kinase  27.59 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0311  hypothetical protein  34.69 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1753  hypothetical protein  30.41 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.141899  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2172  nucleotide kinase-like protein  31.67 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02400  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1535  hypothetical protein  32.77 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000324826 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1134  hypothetical protein  30.73 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384184 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7072  predicted protein  30.87 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1341  hypothetical protein  29.73 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.288027  normal  0.229605 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39137  Predicted nucleotide kinase/nuclear protein involved oxidative stress response  26.92 
 
 
229 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.790891  normal  0.0179425 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08860  essential NTPase (Eurofung)  29.53 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0374  hypothetical protein  29.6 
 
 
153 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.123072 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8345  predicted protein  25 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  41.03 
 
 
307 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  26.24 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  31.15 
 
 
184 aa  42  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>