296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1127 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  99.1 
 
 		 334 aa  665    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  98.5 
 
 		 334 aa  662    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 334 aa  670    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  87.72 
 
 		 334 aa  603  9.999999999999999e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  72.46 
 
 		 333 aa  510  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  50.6 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  49.55 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  50 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  48.96 
 
 		 337 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  49.54 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  47.16 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  48.49 
 
 		 337 aa  318  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  46.9 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  47.93 
 
 		 340 aa  298  7e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  46.61 
 
 		 338 aa  298  8e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  47.46 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  48.7 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  47.52 
 
 		 338 aa  289  4e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  48.41 
 
 		 338 aa  286  2e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  45.1 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  44.38 
 
 		 339 aa  285  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  46.27 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  46.31 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  46.83 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  40.31 
 
 		 331 aa  248  9e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  40.63 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  39.37 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  38.81 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  36.07 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  38.06 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.14 
 
 		 386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  35.62 
 
 		 392 aa  212  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  32.87 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  33.14 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  33.8 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  31.88 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  33.11 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  30.87 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  35.66 
 
 		 210 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  36.67 
 
 		 213 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  34.62 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  30.29 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  35.97 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  34.84 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  32.68 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  34.11 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  28.76 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  31.62 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  27.5 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  32.65 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  28.3 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  33.58 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  29.47 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 218 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  34.38 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  40.22 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  33.11 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  30.05 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  28.24 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  26.58 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  33.59 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  34.11 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000808775  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  30.77 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  34.46 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  29.06 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  31.88 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  27.37 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  27.56 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  29.19 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  31.01 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  35.96 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0767  50S ribosomal protein L3  32.64 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0394  50S ribosomal protein L3  36.96 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  34.53 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  28.12 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  27.81 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  28.12 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  28.12 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  32.12 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0369  50S ribosomal protein L3  36.96 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  32.05 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  32.64 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  31.16 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  35.61 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  32.03 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  32.09 
 
 		 210 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04521  50S ribosomal protein L3  29.46 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000554969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>