40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1126 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  95.24 
 
 		 252 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  93.25 
 
 		 252 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  92.86 
 
 		 252 aa  447  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  75 
 
 		 252 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  53.6 
 
 		 278 aa  249  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  52.59 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  52.8 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  51 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  49.01 
 
 		 251 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  51.39 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  51 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  49.8 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  48.02 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  50.8 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  49.41 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  49.8 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  50.39 
 
 		 285 aa  224  8e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  50.59 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  49.4 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  51.18 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  49.8 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  49.8 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  48.41 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  44.4 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  45.85 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  40.8 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  41.67 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  35.69 
 
 		 387 aa  145  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  36.48 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  33.6 
 
 		 397 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  36.48 
 
 		 372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  34.24 
 
 		 363 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  27.73 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  29.57 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  29.57 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  33.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2817  50S ribosomal protein L4  27.56 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  28.14 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  27.52 
 
 		 206 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>