284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1125 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 86 aa  169  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  98.84 
 
 		 86 aa  167  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  97.67 
 
 		 86 aa  166  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  87.21 
 
 		 86 aa  152  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  77.91 
 
 		 86 aa  140  8e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  50 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  45.88 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  48.81 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  45 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  50.62 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  37.04 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  42.35 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  42.5 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  43.21 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  43.9 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  46.05 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  41.77 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  41.98 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  36.14 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  35 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  40.28 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  44.78 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  41.79 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  41.79 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  41.79 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  34.52 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  35.37 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3820  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000460172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3999  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  45.31 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  35.29 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  42.19 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  38.24 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  40.24 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  40.24 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  35.37 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  44.62 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  46.27 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  46.27 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  38.82 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  41.46 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  44.62 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  42.19 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0330  ribosomal protein L23  45.68 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  39.53 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  42.62 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  34.15 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  39.74 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793915  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  43.75 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  41.46 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  42.42 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  42.19 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  39.13 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04519  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251996  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  42.19 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  37.5 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  35.96 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>