38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1116 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0801  hypothetical protein  93.81 
 
 
436 aa  828    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0867  hypothetical protein  79.82 
 
 
436 aa  729    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1116  methanogenesis marker protein 10  100 
 
 
436 aa  890    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0022  hypothetical protein  91.06 
 
 
436 aa  823    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  66.36 
 
 
455 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2422  hypothetical protein  44.5 
 
 
409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0898  hypothetical protein  44.07 
 
 
411 aa  348  9e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0508  hypothetical protein  45.19 
 
 
413 aa  346  5e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0774462  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1632  hypothetical protein  40.63 
 
 
408 aa  330  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1909  methanogenesis marker protein 10  39.28 
 
 
409 aa  317  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1781  hypothetical protein  39.81 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.415855  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2512  hypothetical protein  40.1 
 
 
408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1316  hypothetical protein  36.3 
 
 
407 aa  290  3e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  25.27 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  28.29 
 
 
441 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  22.99 
 
 
430 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  21.92 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  32.5 
 
 
465 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  32.5 
 
 
448 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  28.71 
 
 
440 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  25.58 
 
 
446 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  33.33 
 
 
470 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  31.94 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  31.94 
 
 
439 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  28.57 
 
 
444 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  30.23 
 
 
470 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  20.15 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  32.5 
 
 
449 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  36.07 
 
 
438 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  29.07 
 
 
459 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  31.52 
 
 
465 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  28.57 
 
 
241 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  29.03 
 
 
449 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  25.6 
 
 
453 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.04 
 
 
326 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  25.6 
 
 
453 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  29.17 
 
 
456 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>