More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0997 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  100 
 
 
546 aa  1124    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  56.91 
 
 
549 aa  644    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  92.31 
 
 
546 aa  1053    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  98.72 
 
 
546 aa  1110    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  74.18 
 
 
543 aa  848    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  95.6 
 
 
546 aa  1087    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  54.71 
 
 
547 aa  597  1e-169  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  50.55 
 
 
557 aa  568  1e-161  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  49.09 
 
 
557 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  49.27 
 
 
557 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  48.45 
 
 
557 aa  541  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  49.35 
 
 
559 aa  529  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  42.88 
 
 
610 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  41.7 
 
 
617 aa  415  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  41.17 
 
 
604 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  42.86 
 
 
620 aa  405  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  39.9 
 
 
622 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  41.05 
 
 
512 aa  386  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  38.29 
 
 
618 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  47.13 
 
 
513 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  36.65 
 
 
547 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  35.15 
 
 
682 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
749 aa  269  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
545 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  38.24 
 
 
609 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  39.9 
 
 
847 aa  265  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  34.99 
 
 
791 aa  264  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  39.29 
 
 
831 aa  264  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  38.34 
 
 
797 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  32.57 
 
 
654 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  37.35 
 
 
628 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  39.79 
 
 
1335 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  33.68 
 
 
542 aa  257  3e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  35.02 
 
 
510 aa  257  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  39.12 
 
 
1319 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  38.58 
 
 
1255 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
671 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  33.19 
 
 
556 aa  252  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  34.27 
 
 
558 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  33.19 
 
 
583 aa  247  4e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  36.64 
 
 
549 aa  246  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  36.16 
 
 
519 aa  243  7e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  35.84 
 
 
549 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  40.19 
 
 
991 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  33.4 
 
 
491 aa  240  5e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  35.35 
 
 
640 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  30.65 
 
 
722 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  37.19 
 
 
692 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  32.65 
 
 
551 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  35.8 
 
 
492 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  35.8 
 
 
492 aa  234  3e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  32.24 
 
 
489 aa  231  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  35.31 
 
 
770 aa  231  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  36.2 
 
 
591 aa  231  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  44.03 
 
 
612 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  35.77 
 
 
572 aa  220  3.9999999999999997e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  35.79 
 
 
577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  36.48 
 
 
311 aa  187  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  31.33 
 
 
473 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  29.33 
 
 
476 aa  170  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  30.99 
 
 
408 aa  167  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  29.72 
 
 
515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  29.35 
 
 
445 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  30.88 
 
 
463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  31.55 
 
 
452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  31.32 
 
 
548 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  30.16 
 
 
553 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  30.86 
 
 
552 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  30.16 
 
 
553 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  30.16 
 
 
553 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  30.16 
 
 
553 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  30.81 
 
 
440 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  32.82 
 
 
544 aa  161  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  29.65 
 
 
480 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  31.95 
 
 
552 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  32.35 
 
 
444 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.13 
 
 
483 aa  160  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  30.21 
 
 
488 aa  159  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  29.57 
 
 
485 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  30.32 
 
 
484 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  30.85 
 
 
433 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  29.57 
 
 
482 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  32.44 
 
 
521 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  30.91 
 
 
498 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  32.8 
 
 
500 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  37.05 
 
 
412 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  30.81 
 
 
504 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  31.34 
 
 
479 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  28.84 
 
 
482 aa  159  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  32.63 
 
 
450 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  29.87 
 
 
476 aa  158  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  28.97 
 
 
482 aa  158  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  30.21 
 
 
467 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  30.21 
 
 
490 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  30.2 
 
 
438 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  30.99 
 
 
463 aa  157  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  29.87 
 
 
485 aa  157  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.55 
 
 
478 aa  156  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  30.36 
 
 
464 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>