More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0922 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  96.42 
 
 
335 aa  652  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  97.31 
 
 
335 aa  659  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
335 aa  675  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  60.48 
 
 
341 aa  425  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  45.88 
 
 
336 aa  307  2e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  36.9 
 
 
350 aa  235  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 
351 aa  234  1e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  37.17 
 
 
371 aa  232  7e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  37.8 
 
 
351 aa  232  7e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 
350 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 
350 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  36.31 
 
 
350 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  34.73 
 
 
347 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  31.83 
 
 
362 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  35 
 
 
333 aa  205  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  35.09 
 
 
331 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  32.93 
 
 
354 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  34.16 
 
 
350 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.96347e-06  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  34.95 
 
 
330 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  32.52 
 
 
338 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.59336e-12  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
355 aa  198  1e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3583e-11 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  34.05 
 
 
346 aa  197  2e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  34.04 
 
 
330 aa  196  4e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  34.25 
 
 
337 aa  196  5e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  33.13 
 
 
330 aa  195  8e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  34.28 
 
 
356 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  34.04 
 
 
330 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  34.04 
 
 
334 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  34.04 
 
 
334 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.93674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  34.28 
 
 
356 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  32.51 
 
 
346 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  33.43 
 
 
330 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.73 
 
 
332 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  31.21 
 
 
341 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  33.43 
 
 
337 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  31.31 
 
 
351 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 
332 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  30.09 
 
 
351 aa  180  3e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  30.09 
 
 
351 aa  180  3e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  30.09 
 
 
351 aa  179  6e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  29.48 
 
 
332 aa  179  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 
325 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  32.25 
 
 
352 aa  174  1e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  35.37 
 
 
341 aa  173  3e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  29.52 
 
 
384 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  29.79 
 
 
335 aa  169  7e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.39413e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  29.45 
 
 
350 aa  168  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  31.08 
 
 
335 aa  167  3e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  29.64 
 
 
346 aa  165  1e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  32.92 
 
 
357 aa  163  5e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  29.76 
 
 
359 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.31 
 
 
345 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  29.97 
 
 
397 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  7.21375e-05  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  31.73 
 
 
366 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  24.77 
 
 
337 aa  148  1e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  27.22 
 
 
352 aa  148  1e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  29.85 
 
 
339 aa  147  2e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  27.61 
 
 
368 aa  147  2e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  28.22 
 
 
351 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  26.37 
 
 
355 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  32.51 
 
 
347 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  27.55 
 
 
352 aa  135  1e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  30.27 
 
 
346 aa  135  1e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  29.23 
 
 
324 aa  135  1e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  29.18 
 
 
346 aa  134  2e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  29.18 
 
 
346 aa  134  2e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  25.83 
 
 
509 aa  133  4e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  31.8 
 
 
388 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  26.44 
 
 
378 aa  116  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 
313 aa  115  9e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  22.22 
 
 
376 aa  114  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  27.96 
 
 
562 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  29.07 
 
 
364 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  24.26 
 
 
376 aa  106  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  29.07 
 
 
364 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  29.07 
 
 
364 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  28.68 
 
 
386 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  32.18 
 
 
531 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  30.45 
 
 
364 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  27.05 
 
 
347 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  32.58 
 
 
182 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  31.08 
 
 
364 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  33.01 
 
 
395 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  29.25 
 
 
395 aa  99.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  22.78 
 
 
376 aa  99.4  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  30.87 
 
 
326 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  30.87 
 
 
326 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  30.87 
 
 
326 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  30.87 
 
 
326 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  31.53 
 
 
369 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  31.53 
 
 
369 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  31.53 
 
 
369 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  31.53 
 
 
413 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  23.18 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  27.95 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
673 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  26.75 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  28 
 
 
393 aa  97.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  27.84 
 
 
544 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  27.72 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>