More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0909 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  100 
 
 		 548 aa  1121    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  82.85 
 
 		 553 aa  939    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  82.85 
 
 		 553 aa  939    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  82.85 
 
 		 553 aa  939    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  91.12 
 
 		 552 aa  1020    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  62.98 
 
 		 544 aa  662    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  82.85 
 
 		 553 aa  939    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  93.84 
 
 		 552 aa  1038    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  38.5 
 
 		 797 aa  268  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  33.8 
 
 		 510 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  32.81 
 
 		 628 aa  260  6e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  38.05 
 
 		 609 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  35.21 
 
 		 547 aa  250  5e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  36.83 
 
 		 640 aa  248  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  37.56 
 
 		 692 aa  247  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  36.48 
 
 		 549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  34.21 
 
 		 583 aa  244  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 558 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  34.28 
 
 		 556 aa  242  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 551 aa  242  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  35.49 
 
 		 682 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  32.83 
 
 		 654 aa  233  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  33.62 
 
 		 749 aa  233  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  36.87 
 
 		 549 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  35.1 
 
 		 591 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  36.76 
 
 		 791 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  34.01 
 
 		 542 aa  231  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 472 aa  230  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  33.61 
 
 		 545 aa  229  7e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  33.2 
 
 		 671 aa  229  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  33.95 
 
 		 1319 aa  228  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  28.91 
 
 		 519 aa  227  5.0000000000000005e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  33.69 
 
 		 1335 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  33.73 
 
 		 991 aa  226  9e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  41.46 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  33.66 
 
 		 770 aa  223  8e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  38.11 
 
 		 504 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  34.09 
 
 		 847 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  34.74 
 
 		 547 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  34.05 
 
 		 1255 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  36.08 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  41.07 
 
 		 482 aa  217  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  41.07 
 
 		 482 aa  216  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  38.76 
 
 		 463 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  39.58 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  38.76 
 
 		 465 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  36.58 
 
 		 480 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  41.88 
 
 		 521 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  37.01 
 
 		 477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  34.8 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  40.44 
 
 		 485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  41.56 
 
 		 508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  39.83 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  38.16 
 
 		 487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  36.22 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  33.69 
 
 		 831 aa  213  7e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  40.58 
 
 		 479 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  34.38 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  37.64 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  38.44 
 
 		 467 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  40.94 
 
 		 483 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  40 
 
 		 464 aa  212  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  34.86 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  41.88 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 488 aa  211  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 488 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  42.01 
 
 		 677 aa  211  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  40.35 
 
 		 444 aa  211  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  41.25 
 
 		 485 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  33.08 
 
 		 489 aa  210  6e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  37.85 
 
 		 477 aa  210  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  40.31 
 
 		 482 aa  210  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  39.88 
 
 		 482 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  36.34 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  35.88 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  38.31 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  39.51 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  35.88 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  36.04 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  35.88 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  35.88 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  36.1 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  35.84 
 
 		 490 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  36.7 
 
 		 441 aa  208  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  43.53 
 
 		 470 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  36 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  35.79 
 
 		 491 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  41.25 
 
 		 492 aa  207  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  40.94 
 
 		 432 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  40.52 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  40.31 
 
 		 484 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  39.69 
 
 		 489 aa  206  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  41.12 
 
 		 498 aa  206  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  34.98 
 
 		 454 aa  206  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  40.52 
 
 		 421 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  36.41 
 
 		 455 aa  206  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>