More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0848 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  91.38 
 
 		 385 aa  634    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  100 
 
 		 383 aa  739    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  87.47 
 
 		 383 aa  627  1e-179  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  80.47 
 
 		 384 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 406 aa  355  1e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.6 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.25 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.25 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.38 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  25.19 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  25.54 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.48 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.22 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 505 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.34 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 447 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.49 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  30.56 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 416 aa  96.3  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  24.86 
 
 		 390 aa  96.3  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  25.54 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  25.54 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  25.54 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  25.54 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  25.47 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  25.66 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25.2 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 410 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  24.6 
 
 		 685 aa  93.6  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 401 aa  92.8  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 393 aa  92.8  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 428 aa  90.9  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  23.85 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  25.49 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  24.78 
 
 		 409 aa  90.5  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 406 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  27.16 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  24.73 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  24.25 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  19.71 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  26.89 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  22.49 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  21.76 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  26.75 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 397 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 421 aa  86.3  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  25.59 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  25.41 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.24 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.71 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>