More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0784 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  81.58 
 
 		 457 aa  726    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  100 
 
 		 460 aa  896    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  88.7 
 
 		 460 aa  800    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  88.26 
 
 		 460 aa  803    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  45.77 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  46.56 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  50.11 
 
 		 458 aa  418  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  46.82 
 
 		 437 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  46.36 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  43.53 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  42.02 
 
 		 473 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  40.27 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  41.2 
 
 		 467 aa  348  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  41.2 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  40.68 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  33.73 
 
 		 460 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  31.49 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  29.07 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 447 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 468 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  31.72 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.12 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.9 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.79 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 462 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  28.42 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 462 aa  146  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  29.27 
 
 		 496 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  25.61 
 
 		 463 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.9 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  27.68 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  38.19 
 
 		 210 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 447 aa  142  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 456 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  26.61 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 452 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 466 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  29.72 
 
 		 454 aa  140  6e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 461 aa  139  8.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  31.98 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 538 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  27.06 
 
 		 455 aa  137  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 493 aa  137  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 467 aa  136  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 486 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  25 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 503 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 452 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 455 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 448 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>