More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0775 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.67 
 
 
739 aa  739  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.37 
 
 
806 aa  688  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.72 
 
 
810 aa  640  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.92 
 
 
709 aa  645  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.39 
 
 
804 aa  642  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  50 
 
 
826 aa  658  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.66 
 
 
715 aa  654  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  45.87 
 
 
810 aa  647  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.64 
 
 
808 aa  744  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.26 
 
 
743 aa  765  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  47.78 
 
 
718 aa  676  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.61 
 
 
732 aa  791  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.24 
 
 
754 aa  739  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.74 
 
 
731 aa  756  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.81 
 
 
736 aa  814  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  46.93 
 
 
764 aa  691  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.23 
 
 
757 aa  699  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.97 
 
 
736 aa  699  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.55 
 
 
740 aa  766  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.62 
 
 
754 aa  706  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.91 
 
 
721 aa  728  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.69 
 
 
704 aa  660  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.52 
 
 
756 aa  732  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.23 
 
 
757 aa  666  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.24 
 
 
754 aa  718  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.22 
 
 
718 aa  790  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.49 
 
 
773 aa  636  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.47 
 
 
738 aa  785  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.84 
 
 
742 aa  759  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.39 
 
 
740 aa  765  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.23 
 
 
731 aa  761  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  44.52 
 
 
732 aa  643  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.74 
 
 
738 aa  731  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  53.44 
 
 
775 aa  802  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  47.24 
 
 
763 aa  718  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.55 
 
 
801 aa  663  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  47.12 
 
 
721 aa  671  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  47.64 
 
 
722 aa  689  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  48.5 
 
 
713 aa  675  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.24 
 
 
737 aa  798  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.14 
 
 
727 aa  798  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.51 
 
 
731 aa  766  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.81 
 
 
768 aa  759  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.74 
 
 
759 aa  697  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.33 
 
 
760 aa  697  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.45 
 
 
769 aa  768  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.49 
 
 
701 aa  650  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  100 
 
 
781 aa  1554  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.33 
 
 
852 aa  709  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.52 
 
 
735 aa  726  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  93.98 
 
 
800 aa  1500  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  90.79 
 
 
781 aa  1417  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  70.95 
 
 
723 aa  1088  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.8 
 
 
719 aa  729  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  43.07 
 
 
804 aa  642  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.25 
 
 
754 aa  755  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.68 
 
 
763 aa  674  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.03 
 
 
753 aa  704  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.18 
 
 
757 aa  663  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  97.44 
 
 
784 aa  1526  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.26 
 
 
742 aa  763  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.54 
 
 
737 aa  782  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.74 
 
 
738 aa  798  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.97 
 
 
731 aa  758  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  50.32 
 
 
754 aa  755  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.4 
 
 
755 aa  647  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  42.11 
 
 
806 aa  621  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.19 
 
 
805 aa  617  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.98 
 
 
772 aa  613  1e-174  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  44.65 
 
 
810 aa  612  1e-174  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.98 
 
 
805 aa  613  1e-174  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  43.69 
 
 
814 aa  603  1e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  44.32 
 
 
829 aa  595  1e-168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.3 
 
 
801 aa  570  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  42.01 
 
 
703 aa  549  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.48 
 
 
730 aa  545  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  40.41 
 
 
699 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  41.43 
 
 
739 aa  528  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  42.62 
 
 
930 aa  525  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  40.54 
 
 
685 aa  518  1e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  44.98 
 
 
788 aa  507  1e-142  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  46.85 
 
 
613 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  43.62 
 
 
550 aa  502  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  42.76 
 
 
703 aa  501  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  47.59 
 
 
776 aa  484  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  40.47 
 
 
746 aa  485  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  40.85 
 
 
803 aa  473  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  42.17 
 
 
691 aa  471  1e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  44.66 
 
 
639 aa  468  1e-130  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  42.12 
 
 
567 aa  461  1e-128  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  41.56 
 
 
647 aa  456  1e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  40.09 
 
 
832 aa  450  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  43.31 
 
 
601 aa  446  1e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  41.86 
 
 
729 aa  432  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  38.5 
 
 
756 aa  426  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  31.27 
 
 
747 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  35.07 
 
 
748 aa  369  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  32.25 
 
 
742 aa  358  3e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  34.07 
 
 
607 aa  352  1e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  35.32 
 
 
749 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>