249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0751 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0751  permease  100 
 
 
318 aa  627  1e-178  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  93.71 
 
 
318 aa  541  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  95.91 
 
 
318 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  70.13 
 
 
318 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  56.65 
 
 
323 aa  360  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  53.87 
 
 
315 aa  358  9e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  51.94 
 
 
315 aa  355  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  55.7 
 
 
323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  54.84 
 
 
315 aa  350  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  57.88 
 
 
317 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  54.31 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  52.87 
 
 
324 aa  335  5e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  52.58 
 
 
315 aa  333  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  51.89 
 
 
319 aa  333  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  53.55 
 
 
315 aa  332  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  51.55 
 
 
323 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  50.64 
 
 
336 aa  325  8.000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  49.36 
 
 
351 aa  322  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  51.1 
 
 
352 aa  322  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  50 
 
 
338 aa  321  8e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  50 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  46.52 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  50.16 
 
 
331 aa  319  3e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  46.52 
 
 
330 aa  318  9e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  53.18 
 
 
315 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  49.04 
 
 
353 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  49.84 
 
 
381 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  47.08 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  48.59 
 
 
319 aa  309  4e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  50 
 
 
337 aa  308  6.999999999999999e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  48.9 
 
 
321 aa  308  8e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  50.32 
 
 
338 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  46.39 
 
 
349 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  48.51 
 
 
363 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  46.56 
 
 
352 aa  301  9e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  45.54 
 
 
377 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  51.89 
 
 
284 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  46.86 
 
 
350 aa  296  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  46.64 
 
 
348 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  45.14 
 
 
341 aa  296  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  45.31 
 
 
364 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  48.58 
 
 
337 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  46.15 
 
 
344 aa  293  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  47.18 
 
 
353 aa  293  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  48.31 
 
 
351 aa  292  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  47.53 
 
 
332 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  49.5 
 
 
345 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  49.04 
 
 
337 aa  291  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  43.89 
 
 
350 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  47.44 
 
 
362 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  49.35 
 
 
349 aa  286  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  46.8 
 
 
354 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  44.31 
 
 
354 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  47.32 
 
 
348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  49.5 
 
 
337 aa  285  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  45.83 
 
 
366 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  45.71 
 
 
322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  45.51 
 
 
366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  45.45 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  42.33 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  46.82 
 
 
351 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  44.87 
 
 
370 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  45.42 
 
 
350 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  43.83 
 
 
353 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  45.57 
 
 
319 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  47.16 
 
 
353 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  39.18 
 
 
335 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  46.91 
 
 
349 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  38.8 
 
 
331 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  38.49 
 
 
331 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  38.49 
 
 
331 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  38.8 
 
 
331 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  38.49 
 
 
331 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  38.8 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  38.49 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  39.5 
 
 
336 aa  245  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  38.44 
 
 
337 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  38.68 
 
 
332 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  38.68 
 
 
332 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  37.42 
 
 
332 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  37.62 
 
 
328 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  38.94 
 
 
316 aa  231  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  38.17 
 
 
330 aa  228  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  35.74 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  36.94 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  36.92 
 
 
371 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  38.05 
 
 
318 aa  211  9e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  35.4 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  33.78 
 
 
318 aa  179  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  31.99 
 
 
311 aa  175  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  31.25 
 
 
301 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  29.28 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  29.47 
 
 
293 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  29.87 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  31.74 
 
 
294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  27.91 
 
 
333 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  28.12 
 
 
359 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  29.94 
 
 
356 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  28.53 
 
 
333 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  30.66 
 
 
294 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>