149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0741 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  96.86 
 
 		 575 aa  1126    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  87.8 
 
 		 574 aa  1061    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  70.16 
 
 		 579 aa  881    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  96.69 
 
 		 574 aa  1150    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 574 aa  1181    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 607 aa  593  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 581 aa  589  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 577 aa  579  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 576 aa  542  1e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 573 aa  541  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 573 aa  543  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 572 aa  528  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 576 aa  531  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 589 aa  494  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 593 aa  484  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  42.74 
 
 		 677 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 630 aa  478  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 586 aa  472  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 557 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 590 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 594 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  38.83 
 
 		 689 aa  444  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 588 aa  436  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 574 aa  433  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  38.9 
 
 		 661 aa  429  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  39.83 
 
 		 702 aa  428  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  37.34 
 
 		 699 aa  423  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 585 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 585 aa  409  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 583 aa  409  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  33.01 
 
 		 602 aa  292  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 497 aa  290  3e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 485 aa  278  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 530 aa  269  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 539 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 551 aa  266  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3369  glycyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 462 aa  256  9e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.0704929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 458 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 462 aa  243  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 467 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 467 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 460 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 458 aa  223  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 451 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 458 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 458 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 458 aa  220  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 434 aa  220  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 462 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 462 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 462 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 457 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 462 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 462 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  33.61 
 
 		 506 aa  207  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 443 aa  207  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 471 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 467 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 473 aa  206  8e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 451 aa  206  1e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 462 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 463 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 462 aa  204  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 490 aa  203  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  34.76 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 467 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf348  glycyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 459 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 462 aa  200  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17070  glycyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0010588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3810  glycyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 459 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0220595 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>