136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0688 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  271  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  97.28 
 
 
147 aa  240  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  94.56 
 
 
147 aa  234  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  31.34 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  29.1 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  32.09 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  30.61 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  36.72 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  29.71 
 
 
146 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  30.28 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  29.1 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  31.3 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  33.59 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  28.77 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  28.17 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  34.68 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  34.86 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  30.34 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  35.14 
 
 
309 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  35.14 
 
 
309 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  32.28 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  34.48 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1459  protein of unknown function DUF606  34.13 
 
 
149 aa  57  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  25.95 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  29.71 
 
 
318 aa  55.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  30.28 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  29.5 
 
 
307 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  28.87 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  28.78 
 
 
183 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  30.99 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  31.43 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  23.74 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2418  hypothetical protein  28.06 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3456  hypothetical protein  33.94 
 
 
154 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  25.34 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0867  protein of unknown function DUF606  30.43 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  27.08 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  24.79 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  27.97 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  29.2 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2420  hypothetical protein  31.62 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  27.7 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  30.3 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3464  hypothetical protein  33.03 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.060266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3257  hypothetical protein  33.03 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3230  hypothetical protein  33.03 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000207849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  33.94 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3512  hypothetical protein  33.03 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  28.7 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3472  hypothetical protein  33.03 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  29.2 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  23.57 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  23.24 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3483  hypothetical protein  33.03 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  29.2 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3164  hypothetical protein  35.71 
 
 
154 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  26.03 
 
 
172 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1792  hypothetical protein  35.71 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2963  hypothetical protein  30.88 
 
 
156 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.41688  normal  0.045431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3167  hypothetical protein  33.03 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  27.97 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2369  hypothetical protein  30.15 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  30.77 
 
 
317 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  25.69 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  37.84 
 
 
176 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  35.21 
 
 
184 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  31.9 
 
 
154 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  32.26 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2965  hypothetical protein  27.94 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108015  normal  0.0601681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  27.86 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2936  hypothetical protein  30 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2619  hypothetical protein  29.51 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  26.19 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  28.47 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  26.12 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  37.18 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  28.87 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2367  hypothetical protein  27.21 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  34.72 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  33.78 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  31.25 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  27.27 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  33.87 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  32.26 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  29.01 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  28.06 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  29.06 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  29.79 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  28.79 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  31.29 
 
 
386 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2213  hypothetical protein  28.68 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  28.45 
 
 
170 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  28.06 
 
 
167 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  28.45 
 
 
178 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  28.06 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  25.93 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>