135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0601 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  85.22 
 
 
433 aa  711    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  850    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  55.43 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  56.09 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0407  hypothetical protein  37.35 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0240441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.62 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  22.59 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0092  protein of unknown function DUF58  21.97 
 
 
473 aa  70.9  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  20.74 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  23.11 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  23.84 
 
 
442 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  21.18 
 
 
444 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  21.76 
 
 
436 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  23.08 
 
 
448 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  27.7 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 
325 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  21.13 
 
 
432 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  26.87 
 
 
444 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25.28 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  19.03 
 
 
440 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  21.51 
 
 
444 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  28.3 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  28.57 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  26.29 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  20.83 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  35.65 
 
 
333 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  27.14 
 
 
428 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  24.34 
 
 
295 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  19.81 
 
 
444 aa  53.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  23.65 
 
 
462 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  26.47 
 
 
552 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  20.56 
 
 
443 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  22.07 
 
 
519 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  20.11 
 
 
447 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  19.81 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  22.09 
 
 
419 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 
310 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  27.66 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  31.82 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  20.71 
 
 
469 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  25.37 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  28.17 
 
 
283 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  27.44 
 
 
384 aa  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  38.89 
 
 
294 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  24.6 
 
 
453 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  25.35 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  19.79 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  27 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2826  protein of unknown function DUF58  18.47 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.493704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  31.58 
 
 
289 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  31.58 
 
 
289 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  31.58 
 
 
289 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  21.71 
 
 
451 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  24.17 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  22.61 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  22.61 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  19.35 
 
 
444 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  34.07 
 
 
292 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  33.73 
 
 
286 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  21.57 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  18.23 
 
 
446 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  37.29 
 
 
351 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  19.63 
 
 
407 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  19.38 
 
 
436 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  22.55 
 
 
463 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  27.17 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  20.86 
 
 
375 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  31.25 
 
 
311 aa  47.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  29.13 
 
 
303 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
295 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  18.8 
 
 
432 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  26.16 
 
 
303 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3708  hypothetical protein  26.35 
 
 
404 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.27 
 
 
290 aa  46.6  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  26.87 
 
 
288 aa  46.6  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  22.13 
 
 
346 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  21.33 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  35.59 
 
 
323 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  24.11 
 
 
443 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2154  protein of unknown function DUF58  22.34 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.690685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  20.47 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  37.04 
 
 
294 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  26.09 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  32.89 
 
 
309 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  17.45 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  17.21 
 
 
431 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  32.99 
 
 
308 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  25.17 
 
 
309 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  36.54 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  22.03 
 
 
302 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  34.78 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  32.63 
 
 
297 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  26.6 
 
 
297 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  31.63 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  29.11 
 
 
298 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  29.35 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  17.92 
 
 
443 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  18.33 
 
 
431 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  25.22 
 
 
404 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>