More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0522 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  79.49 
 
 
390 aa  656    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  94.36 
 
 
390 aa  754    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
390 aa  786    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  93.08 
 
 
390 aa  723    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  69.57 
 
 
391 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  39.95 
 
 
406 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  39.9 
 
 
408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  38.68 
 
 
391 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  41.38 
 
 
407 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  38.19 
 
 
395 aa  243  5e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  38.06 
 
 
397 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  37.75 
 
 
399 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  38.62 
 
 
398 aa  223  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  37.53 
 
 
396 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  37.91 
 
 
402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  36.91 
 
 
398 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  34.44 
 
 
399 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  33.85 
 
 
387 aa  190  4e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  32.77 
 
 
386 aa  189  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  31.47 
 
 
396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  31.89 
 
 
392 aa  172  9e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  32.8 
 
 
391 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  32.48 
 
 
396 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  30.77 
 
 
385 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  31.34 
 
 
386 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  34.13 
 
 
402 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  30.05 
 
 
385 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  32.89 
 
 
416 aa  156  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
385 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  30.94 
 
 
365 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  31.77 
 
 
381 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.52 
 
 
375 aa  133  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  29.4 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.52 
 
 
341 aa  126  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  31.29 
 
 
363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.81 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  29.51 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 
453 aa  117  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 
379 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 
348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.74 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 
376 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  27.72 
 
 
418 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 
413 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 
406 aa  106  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  29.15 
 
 
421 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 
405 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.16 
 
 
379 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 
457 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0513  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
385 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.26 
 
 
375 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 
405 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 
405 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.2 
 
 
446 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28.13 
 
 
380 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.78 
 
 
446 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 
380 aa  99.4  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.52 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.58 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
432 aa  96.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.13 
 
 
380 aa  96.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  28.05 
 
 
455 aa  96.3  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  27.43 
 
 
452 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  29.78 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  26.7 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  30.06 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 
425 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.22 
 
 
468 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 
380 aa  93.2  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 
452 aa  92.8  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 
453 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  29.47 
 
 
353 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 
424 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  29.47 
 
 
353 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.14 
 
 
445 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.05 
 
 
449 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 
394 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 
423 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  30.15 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 
388 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.92 
 
 
423 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>