177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0517 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  100 
 
 
171 aa  346  7e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  98.25 
 
 
171 aa  342  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  96.49 
 
 
171 aa  337  3e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  80.12 
 
 
171 aa  289  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  44.85 
 
 
165 aa  160  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  43.98 
 
 
166 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.24 
 
 
167 aa  132  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  37.58 
 
 
176 aa  121  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  38.89 
 
 
164 aa  121  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  37.2 
 
 
168 aa  120  9e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  35.37 
 
 
175 aa  117  1e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  35.19 
 
 
158 aa  112  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  35.19 
 
 
158 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  34.3 
 
 
173 aa  111  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  37.34 
 
 
158 aa  107  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  36.75 
 
 
168 aa  106  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  36.09 
 
 
168 aa  103  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  37.82 
 
 
158 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.5 
 
 
166 aa  100  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.13 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.95 
 
 
162 aa  98.2  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.36 
 
 
167 aa  97.4  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  34.5 
 
 
166 aa  97.4  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.07 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  34.03 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  29.24 
 
 
176 aa  82.4  2e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  29.94 
 
 
162 aa  75.9  2e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  32.3 
 
 
173 aa  76.3  2e-13  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  34.51 
 
 
180 aa  72.8  2e-12  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.46 
 
 
178 aa  71.6  5e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  29.45 
 
 
174 aa  66.2  2e-10  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.21 
 
 
170 aa  62.8  2e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.05 
 
 
163 aa  62.4  3e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  30.25 
 
 
152 aa  62  4e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.21 
 
 
175 aa  60.5  1e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.67 
 
 
159 aa  60.1  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  29.65 
 
 
157 aa  59.7  2e-08  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.87 
 
 
170 aa  59.7  2e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  31.21 
 
 
151 aa  59.7  2e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  27.54 
 
 
148 aa  58.9  3e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  29.81 
 
 
172 aa  58.9  4e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  30 
 
 
172 aa  58.5  4e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  29.81 
 
 
172 aa  58.9  4e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.41 
 
 
182 aa  57.8  6e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.55 
 
 
162 aa  57.8  8e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  32.08 
 
 
156 aa  57.8  8e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.79 
 
 
172 aa  57.4  9e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  32.9 
 
 
164 aa  57.4  9e-08  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  30.63 
 
 
160 aa  57.4  1e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.91 
 
 
165 aa  57  1e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.09 
 
 
168 aa  57  1e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.52538e-11 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.49 
 
 
172 aa  55.5  4e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  32.87 
 
 
164 aa  55.5  4e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.32589e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  29.17 
 
 
168 aa  55.5  4e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  26.9 
 
 
174 aa  55.1  4e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.3 
 
 
171 aa  55.5  4e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.95 
 
 
179 aa  55.1  5e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.07557e-06  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.17 
 
 
186 aa  54.7  7e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  28.04 
 
 
185 aa  54.3  8e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  29.19 
 
 
153 aa  53.5  1e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.34 
 
 
162 aa  53.5  1e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  31.37 
 
 
154 aa  53.9  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.67 
 
 
169 aa  53.9  1e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  24.53 
 
 
183 aa  53.9  1e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  8.44745e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  31.21 
 
 
186 aa  53.9  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  28.99 
 
 
159 aa  53.5  1e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  33.81 
 
 
162 aa  53.1  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  30.5 
 
 
161 aa  52.8  2e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  31.51 
 
 
181 aa  53.1  2e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  27.07 
 
 
182 aa  52.8  2e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.97 
 
 
169 aa  52.4  3e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  27.59 
 
 
155 aa  52.4  3e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  27.86 
 
 
153 aa  52  4e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  31.03 
 
 
163 aa  52  4e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  28.87 
 
 
160 aa  51.6  5e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.1 
 
 
166 aa  51.6  5e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.4 
 
 
210 aa  51.6  6e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.87 
 
 
158 aa  51.2  6e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
167 aa  51.2  6e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  33.1 
 
 
182 aa  51.2  7e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  24.32 
 
 
177 aa  51.2  8e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.74 
 
 
162 aa  51.2  8e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  27.47 
 
 
181 aa  50.8  8e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  25.49 
 
 
178 aa  50.8  8e-06  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.37 
 
 
181 aa  50.8  9e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.87 
 
 
182 aa  50.8  9e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  28.92 
 
 
176 aa  50.4  1e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  29.41 
 
 
166 aa  50.4  1e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  27.81 
 
 
195 aa  50.1  2e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14035e-07 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.66 
 
 
164 aa  49.7  2e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
163 aa  50.1  2e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  25.28 
 
 
188 aa  49.3  3e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.67 
 
 
160 aa  49.3  3e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.68 
 
 
156 aa  49.3  3e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  7.39352e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.9 
 
 
169 aa  48.9  3e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  28.76 
 
 
163 aa  48.5  4e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  26.62 
 
 
162 aa  48.9  4e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  27.16 
 
 
181 aa  48.5  4e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>