211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0475 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 316 aa  647    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  91.14 
 
 		 316 aa  599  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  73.1 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  92.55 
 
 		 255 aa  490  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  57.44 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  52.61 
 
 		 290 aa  338  8e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  35.9 
 
 		 483 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  36.19 
 
 		 483 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.07 
 
 		 502 aa  175  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  34.8 
 
 		 486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  32.97 
 
 		 490 aa  172  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.99 
 
 		 486 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  34.75 
 
 		 494 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.03 
 
 		 483 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  33.21 
 
 		 489 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  32.72 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  34.24 
 
 		 499 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  33.68 
 
 		 490 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  30.03 
 
 		 486 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.84 
 
 		 492 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.53 
 
 		 499 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  32.46 
 
 		 528 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  31.33 
 
 		 484 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  31.33 
 
 		 484 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  35.29 
 
 		 495 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  32.99 
 
 		 496 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  31.5 
 
 		 486 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  33.07 
 
 		 518 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  33.07 
 
 		 518 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.4 
 
 		 502 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  31.44 
 
 		 495 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  30.29 
 
 		 524 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  30.94 
 
 		 529 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  30.66 
 
 		 526 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  30.68 
 
 		 495 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.66 
 
 		 526 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  30.94 
 
 		 515 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.14 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  29.81 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  22.67 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.35 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.65 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.64 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  25.82 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.89 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.23 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.13 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  27 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  23.44 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.94 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  23.92 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2190  D-alanine--D-alanine ligase  23.02 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.62 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.8 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.95 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  24.29 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  25.46 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.18 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  22.95 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  22.83 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  24.57 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  27.95 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.79 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.31 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  24.06 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  20.88 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  23.2 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.23 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.23 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  23.29 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.22 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  21.57 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  22.9 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  23.13 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  27.08 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  22.44 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  22.44 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.92 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  22.17 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  23.97 
 
 		 265 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.95 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  22.95 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  22.95 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  25.81 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  22.95 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.47 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  21.67 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  27.87 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.35 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  22.84 
 
 		 265 aa  52.8  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  25.35 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.32 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.3 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  22.5 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  19.82 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.21 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  20.2 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  23.87 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  23.28 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  25.66 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>