More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0459 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  100 
 
 
342 aa  677    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  93.47 
 
 
338 aa  634    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  94.66 
 
 
337 aa  640    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  79.82 
 
 
336 aa  522  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  54.94 
 
 
343 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  42.94 
 
 
364 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  42.16 
 
 
366 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  37.26 
 
 
370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  37.74 
 
 
377 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  35.17 
 
 
377 aa  203  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  34.76 
 
 
378 aa  199  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 
384 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  35.53 
 
 
395 aa  189  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  38.41 
 
 
370 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  33.78 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 
378 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  32.56 
 
 
393 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  36.09 
 
 
415 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  39.74 
 
 
376 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  44.78 
 
 
239 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  33.04 
 
 
373 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  34.37 
 
 
373 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  32.89 
 
 
375 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  32.45 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  32.35 
 
 
375 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  31.27 
 
 
386 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  30.47 
 
 
412 aa  155  8e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  32.87 
 
 
380 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  32.2 
 
 
365 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  32.65 
 
 
373 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  31 
 
 
372 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  31.99 
 
 
385 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  31.77 
 
 
377 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  31.72 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  30.64 
 
 
368 aa  145  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  31.32 
 
 
380 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  35.55 
 
 
258 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  31.21 
 
 
404 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  30.65 
 
 
380 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  28.1 
 
 
370 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  28.57 
 
 
390 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  32.58 
 
 
394 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  28.3 
 
 
383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  28.61 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  31.58 
 
 
396 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  33.45 
 
 
372 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  39.47 
 
 
301 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  34.37 
 
 
366 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  33.81 
 
 
366 aa  125  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  30.72 
 
 
392 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  28.88 
 
 
374 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  28.8 
 
 
388 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  29.52 
 
 
373 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  31.28 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  29.03 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  29.27 
 
 
375 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  27.32 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  28.34 
 
 
403 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  27.17 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  27.27 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  32.67 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  29.16 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  28.93 
 
 
396 aa  113  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  25.68 
 
 
381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  28.57 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  26.88 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  29.64 
 
 
385 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  26.16 
 
 
361 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  26.91 
 
 
371 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  32.45 
 
 
413 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  25.93 
 
 
370 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  28.69 
 
 
373 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  29.25 
 
 
416 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  34.14 
 
 
376 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  28.17 
 
 
292 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  28.73 
 
 
381 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  25.38 
 
 
417 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  25.38 
 
 
417 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  35.55 
 
 
293 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  30.13 
 
 
400 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  26.49 
 
 
374 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  26.49 
 
 
374 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  33.66 
 
 
285 aa  99.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  28.62 
 
 
373 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  26.96 
 
 
431 aa  96.7  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  34.78 
 
 
291 aa  95.9  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  36.22 
 
 
362 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  32.07 
 
 
424 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  24.93 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  30.85 
 
 
405 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  31.46 
 
 
290 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  31.9 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  27.27 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  28.74 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  35.33 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  35.83 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  33.04 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  31.49 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  30.77 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33078  predicted protein  32.31 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.638325  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>