98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0375 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0375  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
176 aa  348  3e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.397371  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1091  beta-lactamase domain-containing protein  92.05 
 
 
176 aa  320  6e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.801328  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1537  beta-lactamase domain-containing protein  88.07 
 
 
176 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299515  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1673  beta-lactamase domain-containing protein  69.89 
 
 
174 aa  235  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.779907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0442  beta-lactamase domain-containing protein  56.14 
 
 
174 aa  180  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000184233  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1483  beta-lactamase domain-containing protein  47.49 
 
 
182 aa  147  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.550201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1633  beta-lactamase domain-containing protein  45.25 
 
 
180 aa  141  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.101442  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0281  beta-lactamase domain-containing protein  45.81 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0995  beta-lactamase domain-containing protein  48.72 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0941  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 
185 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  26.15 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 
249 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
205 aa  61.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 
205 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  28.32 
 
 
253 aa  59.3  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
233 aa  57.8  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 
204 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 
205 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1727  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
219 aa  54.7  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  32.37 
 
 
250 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 
250 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 
250 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  28.67 
 
 
261 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
250 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 
250 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 
255 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 
235 aa  49.3  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 
246 aa  49.3  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  30.22 
 
 
250 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  26.61 
 
 
229 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 
229 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  22.37 
 
 
266 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  24.62 
 
 
331 aa  47.8  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  30.86 
 
 
215 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0657  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 
376 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 
253 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  39.47 
 
 
244 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 
226 aa  45.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  42.19 
 
 
228 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 
207 aa  45.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  42.19 
 
 
228 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  42.19 
 
 
228 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 
209 aa  45.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1853  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
356 aa  45.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 
209 aa  45.1  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 
207 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 
228 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  21.91 
 
 
259 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  41.27 
 
 
228 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 
203 aa  44.3  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  26.9 
 
 
207 aa  43.9  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  29.63 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  23.57 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  41.27 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  30.95 
 
 
361 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 
257 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  23.81 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  30.21 
 
 
354 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  21.91 
 
 
259 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  21.09 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 
257 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  21.91 
 
 
259 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.38 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  19.64 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  30.12 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  41.27 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  22.52 
 
 
266 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
318 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  41.27 
 
 
308 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
239 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  29.29 
 
 
266 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2260  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 
234 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  23.63 
 
 
229 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 
272 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 
272 aa  42.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  21.71 
 
 
271 aa  42.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 
217 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  27.17 
 
 
346 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
204 aa  42  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  53.12 
 
 
269 aa  42  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0383  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
213 aa  41.6  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1251  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
196 aa  41.6  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.809975  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  24.78 
 
 
213 aa  41.2  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  36.11 
 
 
228 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3485  AHL-lactonase  36.71 
 
 
94 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0078  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 
209 aa  40.8  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 
244 aa  40.8  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  26.39 
 
 
207 aa  40.8  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>