19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0324 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  83.83 
 
 
535 aa  837    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  100 
 
 
531 aa  1049    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  83.65 
 
 
532 aa  866    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0045  S-layer protein  31.48 
 
 
532 aa  239  9e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198912  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  34.22 
 
 
562 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  33.45 
 
 
558 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  32.81 
 
 
561 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  33.82 
 
 
562 aa  224  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1370  S-layer protein  31.71 
 
 
567 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0683  S-layer protein  29.42 
 
 
538 aa  206  8e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0742683  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1780  S-layer protein  29.52 
 
 
533 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.423468  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0123  S-layer protein  31.7 
 
 
532 aa  200  6e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.539086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  31.94 
 
 
1336 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0802  S-layer protein  34.51 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.648701  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  38.38 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  46.67 
 
 
976 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0084  S-layer protein  36 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0737  hypothetical protein  33.33 
 
 
447 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.854836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1181  S-layer family protein  33.33 
 
 
447 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>