More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0309 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
865 aa  775    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  72.22 
 
 
906 aa  1384    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 
886 aa  1821    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
869 aa  831    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
864 aa  802    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  84.99 
 
 
886 aa  1598    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  97.86 
 
 
886 aa  1791    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  97.07 
 
 
886 aa  1785    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
865 aa  798    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
865 aa  848    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
863 aa  773    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
863 aa  771    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
858 aa  675    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
855 aa  827    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
809 aa  703    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
905 aa  593  1e-168  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
908 aa  589  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
928 aa  587  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
896 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
892 aa  559  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 
816 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
802 aa  537  1e-151  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
808 aa  528  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
808 aa  520  1e-146  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
771 aa  488  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
880 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
880 aa  485  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
881 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
884 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
864 aa  480  1e-134  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
865 aa  479  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
799 aa  480  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
881 aa  477  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
865 aa  478  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
874 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
806 aa  478  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
892 aa  478  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
799 aa  473  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
882 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
885 aa  471  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
799 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
799 aa  469  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 
879 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
880 aa  465  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
866 aa  465  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
881 aa  458  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
883 aa  459  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 
883 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
881 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
874 aa  455  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
882 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
886 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
879 aa  452  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
881 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
887 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
881 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2765  valyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 
883 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.700056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
881 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
881 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 
881 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 
906 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
881 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
883 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.08 
 
 
846 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
881 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
881 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
881 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  31.79 
 
 
861 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 
867 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
881 aa  445  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
883 aa  446  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
894 aa  446  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  32.47 
 
 
858 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 
881 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
894 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
887 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
876 aa  436  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
876 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 
881 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
845 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  32.89 
 
 
836 aa  439  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
876 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
881 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 
885 aa  437  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
892 aa  439  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
885 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
879 aa  435  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
901 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
891 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
871 aa  435  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
886 aa  432  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
884 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 
877 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
876 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 
884 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
855 aa  428  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 
880 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 
897 aa  429  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  30.54 
 
 
916 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 
886 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>