More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0306 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
389 aa  743    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  98.46 
 
 
389 aa  734    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  96.64 
 
 
387 aa  618  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  61.78 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 
712 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  29.32 
 
 
715 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.25 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  29.16 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 
719 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  28.46 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  28.76 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  28.76 
 
 
375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  28.76 
 
 
375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  28.76 
 
 
375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  28.76 
 
 
375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.78 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.91 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  28.5 
 
 
375 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  26.75 
 
 
389 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  28.46 
 
 
387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  28.46 
 
 
387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.97 
 
 
375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  29.26 
 
 
387 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  28.99 
 
 
387 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  28.99 
 
 
387 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  28.99 
 
 
387 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 
709 aa  132  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  28.99 
 
 
387 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  28.99 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  27.6 
 
 
375 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  28.16 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 
530 aa  129  6e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  27.13 
 
 
379 aa  129  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  25.72 
 
 
751 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  27.04 
 
 
722 aa  126  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  28.76 
 
 
375 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  28.76 
 
 
375 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  28.76 
 
 
375 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 
396 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 
721 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  26.47 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 
392 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 
392 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  25.79 
 
 
716 aa  116  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 
392 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 
732 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 
692 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 
716 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  25.85 
 
 
389 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 
382 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 
389 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.61 
 
 
399 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 
686 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 
412 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  24.15 
 
 
727 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  26 
 
 
611 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 
609 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 
698 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 
708 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  27.13 
 
 
609 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  26.08 
 
 
614 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.94 
 
 
609 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  26.94 
 
 
609 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  26.94 
 
 
609 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.65 
 
 
609 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.94 
 
 
609 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.55 
 
 
609 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.94 
 
 
609 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.55 
 
 
609 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 
698 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  24.02 
 
 
688 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 
614 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  24.16 
 
 
423 aa  103  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 
614 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  25.95 
 
 
445 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  24.56 
 
 
414 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.88 
 
 
608 aa  102  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  26.81 
 
 
679 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.29 
 
 
609 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 
609 aa  99  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.7 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  24.47 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  25.54 
 
 
689 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 
706 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  23.06 
 
 
395 aa  97.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  24.07 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  27.41 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  26.47 
 
 
388 aa  96.3  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.07 
 
 
484 aa  96.3  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  27.4 
 
 
424 aa  96.3  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.66 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 
715 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
424 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 
715 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  25.77 
 
 
767 aa  93.6  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  27.2 
 
 
399 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>