149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0268 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  95.95 
 
 
222 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  93.24 
 
 
222 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  78.73 
 
 
221 aa  352  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  45.5 
 
 
231 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  47 
 
 
225 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  46.54 
 
 
225 aa  184  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  47.95 
 
 
224 aa  184  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  49.77 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  41.92 
 
 
232 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  41.05 
 
 
232 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  41.05 
 
 
232 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  44.95 
 
 
224 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  38.12 
 
 
349 aa  157  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  38.18 
 
 
240 aa  154  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  38.71 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  37.61 
 
 
246 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  35.78 
 
 
247 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  35.78 
 
 
247 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  35.32 
 
 
247 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  36.07 
 
 
225 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  39.07 
 
 
228 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4143  protein of unknown function DUF124  31.98 
 
 
226 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  36.7 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  39.37 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  39.37 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  36.87 
 
 
227 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  33.93 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34470  conserved hypothetical protein TIGR00266  33.63 
 
 
225 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911046  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5374  protein of unknown function DUF124  32.13 
 
 
228 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  35.51 
 
 
227 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  37.17 
 
 
226 aa  121  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  34.56 
 
 
233 aa  121  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  34.6 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  34.1 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  34.1 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5534  hypothetical protein  31.19 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789066  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0457  hypothetical protein  33.02 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  31.6 
 
 
229 aa  109  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  33.99 
 
 
238 aa  108  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  34.07 
 
 
259 aa  105  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  30.74 
 
 
259 aa  104  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  32.77 
 
 
259 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  32.77 
 
 
253 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  33.04 
 
 
228 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3621  protein of unknown function DUF124  31.03 
 
 
232 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002888  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  30.21 
 
 
262 aa  102  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  35.43 
 
 
275 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  34.08 
 
 
277 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  32.88 
 
 
327 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  32.14 
 
 
267 aa  99.8  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  31.56 
 
 
263 aa  99.4  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  30.94 
 
 
338 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  32.6 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  35.65 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  29.58 
 
 
270 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  33.65 
 
 
291 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  29.92 
 
 
266 aa  95.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  34.33 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  34.5 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  32.07 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  31.65 
 
 
264 aa  92  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  28.92 
 
 
316 aa  91.7  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  31.65 
 
 
264 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  31.65 
 
 
264 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  33.62 
 
 
234 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  34.26 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  31.65 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  30.08 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  30.49 
 
 
261 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  32.07 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  31.22 
 
 
264 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  31.22 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  34.07 
 
 
264 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  30.81 
 
 
250 aa  89  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  30.5 
 
 
250 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  30.8 
 
 
264 aa  88.6  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  30.8 
 
 
264 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  30.38 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  30.8 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0078  hypothetical protein  27.88 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  29.44 
 
 
336 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  30.61 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  32.2 
 
 
253 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  33.03 
 
 
260 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  33.03 
 
 
260 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  32.2 
 
 
253 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  33.03 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02993  DUF124 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G08610)  29.86 
 
 
373 aa  84  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29967  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  33.8 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  34.29 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  33.48 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  33.48 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  33.79 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  33.8 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  30.52 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  27.59 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  27.4 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  36.1 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>