141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0184 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  87.71 
 
 		 179 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  81.56 
 
 		 179 aa  295  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  66.29 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  35.07 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  23.31 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  27.01 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  24.49 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  28.7 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  25.15 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  22.62 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  26.04 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  29.35 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  19.53 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  23.17 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  24.71 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  35.44 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  24.79 
 
 		 255 aa  51.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  28.44 
 
 		 316 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 112 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  36.28 
 
 		 112 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  25.9 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  33.77 
 
 		 252 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 220 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  27.88 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  32.47 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 181 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  25.97 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  32.41 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  45.57 
 
 		 148 aa  48.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  21.1 
 
 		 208 aa  47.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  30.94 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  30.34 
 
 		 277 aa  47.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  25.49 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 110 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  31.82 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  32.05 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 240 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  32.88 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 372 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  43.48 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  21.48 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  25.86 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  24.1 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  25.27 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  32.5 
 
 		 178 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  28.21 
 
 		 109 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 184 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  23.84 
 
 		 218 aa  44.3  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  31.51 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  28.43 
 
 		 250 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  29.87 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  24.35 
 
 		 271 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  31.11 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  31.51 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 114 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>