49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0096 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1050    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  33.41 
 
 
421 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  26.27 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  24.1 
 
 
477 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0917  hypothetical protein  23 
 
 
507 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0745542  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1909  hypothetical protein  23.25 
 
 
507 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00480674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3801  hypothetical protein  23.25 
 
 
507 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  22.02 
 
 
477 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0577  terminase B protein, putative  23.66 
 
 
430 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  22.66 
 
 
476 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  22.66 
 
 
476 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  21.57 
 
 
427 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  25.75 
 
 
418 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0324  putative terminase B protein  24.43 
 
 
430 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1131  putative terminase B protein  24.43 
 
 
430 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.815847  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  22.97 
 
 
457 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1625  prophage, terminase, ATPase subunit, putative  22.39 
 
 
599 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  29.94 
 
 
496 aa  53.5  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  22.83 
 
 
426 aa  53.5  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  21.74 
 
 
523 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  22.12 
 
 
478 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1100  hypothetical protein  30.92 
 
 
423 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0366334 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0037  Ppx/GppA family phosphatase  24.18 
 
 
433 aa  52  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  24.3 
 
 
503 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  22.49 
 
 
482 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  24.17 
 
 
478 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1915  hypothetical protein  26.14 
 
 
260 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436221  hitchhiker  0.00000000650109 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0456  hypothetical protein  25.35 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756141  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0719  hypothetical protein  24.88 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  22.9 
 
 
594 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  28 
 
 
583 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  24.55 
 
 
441 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  24.26 
 
 
601 aa  48.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  23.53 
 
 
589 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  26.67 
 
 
588 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  23.78 
 
 
587 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  26.62 
 
 
577 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  24.31 
 
 
533 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  22.22 
 
 
589 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_300  hypothetical protein  21.8 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1219  hypothetical protein  23.72 
 
 
491 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1890  hypothetical protein  21.54 
 
 
534 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000136884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  24.52 
 
 
452 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  23.84 
 
 
601 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6968  hypothetical protein  23.32 
 
 
466 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  27.03 
 
 
589 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0339  hypothetical protein  22.25 
 
 
457 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  22.08 
 
 
590 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_002936  DET0357  hypothetical protein  22.83 
 
 
441 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>