186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0041 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 397 aa  810    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  40.62 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  35.73 
 
 		 385 aa  235  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  33.25 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  32.93 
 
 		 422 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  32.92 
 
 		 418 aa  215  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  32.92 
 
 		 418 aa  215  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  32.6 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  31.2 
 
 		 415 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.26 
 
 		 412 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  28.95 
 
 		 417 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  30.93 
 
 		 373 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1094  restriction modification system DNA specificity domain protein  43.29 
 
 		 205 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0782363  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  31.67 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3768  restriction modification system DNA specificity subunit  41.36 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  46.71 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  29.63 
 
 		 364 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  37.87 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  42.68 
 
 		 351 aa  139  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.18 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  32.97 
 
 		 411 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  32.97 
 
 		 411 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.44 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.27 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  40.85 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  30.77 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  28.64 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.87 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  27.59 
 
 		 422 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.66 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  26.4 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  29.69 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  27.25 
 
 		 549 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  26.38 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  27.27 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  25.9 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  26.1 
 
 		 412 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  25.41 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  24.75 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.23 
 
 		 620 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  26.11 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  30.81 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  25.74 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  28.63 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  26.22 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  35.26 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.47 
 
 		 493 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  25.92 
 
 		 453 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  27.27 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  29.63 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0987  restriction modification system DNA specificity subunit  24.49 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  29.15 
 
 		 285 aa  96.3  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  25.91 
 
 		 483 aa  96.3  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  24.34 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  26.17 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  31.11 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  26.35 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2988  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.23 
 
 		 386 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  24.62 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.19 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  26.2 
 
 		 398 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2743  type I restriction-modification system, S subunit, truncation  28.57 
 
 		 175 aa  86.3  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.441032  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  27.85 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  28.8 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  24.22 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  25.15 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  21.88 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  28.92 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12768  type I restriction/modification system specificity determinant hsdS.1  40.23 
 
 		 91 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  25.92 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4810  putative type I restriction-modification system specificity subunit  25.79 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  31.68 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3352  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  29.38 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000513186  normal  0.0100815 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  23.19 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  26.67 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  24.92 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3351  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  23.32 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00146581  normal  0.0102246 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  24.88 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  26.52 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  26.94 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  29.76 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  29.03 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12774  type I restriction/modification system specificity determinant hsdS  27.82 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  27.17 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  25.71 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  22.56 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  24.93 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  27.07 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  29.59 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  29.03 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  30.28 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  21.48 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.86 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  24.43 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.75 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1411  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  26.04 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.202691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.88 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  25.4 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  20.58 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  24.69 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>