More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0036 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  100 
 
 		 324 aa  656    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  97.22 
 
 		 324 aa  642    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  75 
 
 		 324 aa  521  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  53.85 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  53.85 
 
 		 322 aa  345  5e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  54.57 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  50.15 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  49.54 
 
 		 322 aa  318  9e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  47.95 
 
 		 323 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  48.73 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  47.7 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  47.7 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  47.71 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  46.98 
 
 		 321 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1846  putative integrase/recombinase  45.07 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  45.6 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  35.78 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  37.91 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  36.94 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  26.48 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  27.89 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  29.07 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  24.13 
 
 		 319 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  25.08 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  28.62 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.07 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  24.76 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  24.35 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  24.37 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  34.34 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  28.62 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  24.76 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  24.92 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  25.39 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  25.82 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  26.8 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  24.73 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  30.72 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  31.84 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  23.25 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  32.53 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  23.08 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  25.34 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  34.81 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  23 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.46 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 412 aa  75.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  28.32 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  27.55 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  23.1 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  25.46 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.08 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  32.47 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  26.53 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  25 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.68 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  25.65 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.17 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  22.76 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  24.09 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2674  phage integrase family protein  32.95 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  25.22 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  25.22 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.09 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  28.92 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  26.09 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  26.82 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  27.34 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  25 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  25.67 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  33.12 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.12 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25.52 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.1 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  23.18 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2366  integrase family protein  25.09 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.18523  hitchhiker  0.000000198716 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  27.02 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2746  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  27.8 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  31.48 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  29.51 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  23.1 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  25.09 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>