27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0026 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0026  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  181  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0031  putative transcriptional regulator  51.58 
 
 		 95 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.154381  hitchhiker  0.000228125 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1653  transcriptional regulator PadR family protein  48.86 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.294087  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0104  transcriptional regulator PadR family protein  44.09 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0244  transcriptional regulator  47.83 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0274  regulatory protein MarR  49.43 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0024  hypothetical protein  43.75 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.552032  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0105  transcriptional regulator PadR family protein  45.56 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0566  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.562571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1513  transcriptional regulator PadR family protein  44.94 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661269  hitchhiker  0.0000096713 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0425  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0443  transcriptional regulator PadR family protein  43.48 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1499  HxlR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.353252  hitchhiker  0.00266513 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1286  transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1228  hypothetical protein  40.74 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1124  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0128  transcriptional regulator PadR family protein  37.35 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1486  regulatory protein, MarR  38.04 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0942  hypothetical protein  36.59 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0763  hypothetical protein  35.48 
 
 		 322 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2818  transcriptional regulator, HxlR family  38.57 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  39.66 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3364  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159843  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1542  transcriptional regulator, HxlR family  37.1 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1397  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>