23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_R0007 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.950757  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0010  tRNA-Ser  98.86 
 
 		 88 bp  167  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0019  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0043  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020807  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0043  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0041  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0057  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2818  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000985587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2065  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000178932  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2161  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000713726  normal  0.978327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2218  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00379666  normal  0.543792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2165  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00542927  normal  0.154256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0969  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000352025  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1149  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000101348  hitchhiker  0.0000000000000214207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.292826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0066  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  0.681656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5040  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4672  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000507057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00032  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000331013  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0397801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>