More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1809 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  434  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  97.74 
 
 
221 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  97.74 
 
 
221 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  88.69 
 
 
221 aa  387  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  34.7 
 
 
450 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  34.58 
 
 
449 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  36.12 
 
 
226 aa  126  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  35.19 
 
 
218 aa  125  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  36.11 
 
 
445 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.96 
 
 
221 aa  122  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.96 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  32.42 
 
 
443 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  30.91 
 
 
452 aa  118  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  32.46 
 
 
448 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  30 
 
 
450 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  33.17 
 
 
449 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  35.56 
 
 
477 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  30.37 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  28.23 
 
 
449 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  32.73 
 
 
448 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  34.58 
 
 
449 aa  112  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  31.14 
 
 
444 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  30.92 
 
 
218 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  33.63 
 
 
450 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  33.94 
 
 
221 aa  111  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.55 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  27.15 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  31.58 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  28.05 
 
 
228 aa  109  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  34.67 
 
 
453 aa  109  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  29.82 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  32.87 
 
 
465 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 
457 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 
231 aa  108  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  31.6 
 
 
457 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  32.29 
 
 
225 aa  105  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  31.6 
 
 
445 aa  104  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  29.49 
 
 
227 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 
218 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  28.96 
 
 
219 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  26.64 
 
 
454 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  32.42 
 
 
457 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  30.66 
 
 
457 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  30.28 
 
 
465 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
457 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  30.77 
 
 
458 aa  101  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  32.3 
 
 
458 aa  101  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  31.37 
 
 
224 aa  101  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  30.45 
 
 
457 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
457 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  30.05 
 
 
458 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  31.14 
 
 
458 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  30.87 
 
 
458 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  31.14 
 
 
458 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  26.17 
 
 
454 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  40.46 
 
 
206 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  29.25 
 
 
444 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  31.13 
 
 
457 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 
459 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  27.07 
 
 
458 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  30.62 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  31.3 
 
 
458 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  30.45 
 
 
457 aa  99  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  29.55 
 
 
221 aa  99  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  29.05 
 
 
223 aa  98.6  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
229 aa  98.6  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.85 
 
 
454 aa  98.2  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  28.05 
 
 
222 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
229 aa  98.2  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 
222 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 
222 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  31.84 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  30.26 
 
 
458 aa  98.2  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  30.19 
 
 
444 aa  98.2  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
457 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  27.94 
 
 
241 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  30.7 
 
 
458 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  29.22 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  30.87 
 
 
458 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
457 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
457 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 
448 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2218  potassium transporter peripheral membrane component  30.97 
 
 
446 aa  97.1  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000230921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  29.36 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
445 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
457 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  30.34 
 
 
458 aa  97.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  30.99 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 
458 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  31.86 
 
 
458 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  31.86 
 
 
458 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  32.02 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  31.86 
 
 
458 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>