152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1773 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1773  redox-active disulfide protein 1  100 
 
 
80 aa  158  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1036  redox-active disulfide protein 1  96.25 
 
 
80 aa  154  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0908  redox-active disulfide protein 1  93.75 
 
 
80 aa  153  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0941  redox-active disulfide protein 1  83.75 
 
 
80 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.917441  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0503  redox-active disulfide protein 1  63.29 
 
 
82 aa  105  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0329  glutaredoxin  41.77 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.923788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1101  NADH dehydrogenase  39.19 
 
 
210 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4420  thioredoxin/glutaredoxin  37.14 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0845291  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0153  glutaredoxin-like domain-containing protein  36.59 
 
 
230 aa  53.9  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.369669  normal  0.0212592 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1277  glutaredoxin-like domain protein  33.85 
 
 
216 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  39.24 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2234  thioredoxin:glutaredoxin  34.18 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  35.06 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  46.58 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2778  redox-active disulfide protein 2  43.06 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  41.56 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  38.36 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3446  thioredoxin family protein, selenocysteine-containing  33.33 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238909  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2110  glutaredoxin-like domain protein  31.65 
 
 
213 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.405211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  37.97 
 
 
107 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2727  dehydrogenase, selenocysteine-containing protein  32.31 
 
 
228 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.305713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  34.18 
 
 
104 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  34.85 
 
 
85 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  34.85 
 
 
85 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  36.99 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2537  glutaredoxin-like domain protein  32.91 
 
 
215 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.5 
 
 
548 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1569  glutaredoxin-like domain-containing protein  33.72 
 
 
243 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000134585 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  32.05 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  34.18 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0162  thioredoxin domain protein  34.67 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142979  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  32.05 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  34.18 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  34.18 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  32.05 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  35.62 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  35.62 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0102  hypothetical protein  35.8 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0850062  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2867  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.940761  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2488  hypothetical protein  33.33 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  34.18 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0759  glutaredoxin-like domain protein  29.49 
 
 
227 aa  45.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1173  glutaredoxin-like domain protein  30.86 
 
 
233 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  42.59 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1697  glutaredoxin-like domain-containing protein  34.48 
 
 
243 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000123601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  37.97 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  40.26 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  35.19 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  36.84 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  35.62 
 
 
108 aa  43.9  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  33.77 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  30.49 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  34.25 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  34.18 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  36.71 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  35.85 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.33 
 
 
560 aa  42.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  35.19 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  34.25 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  31.25 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  34.67 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  32.05 
 
 
108 aa  42.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  29.49 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  35.19 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2049  glutaredoxin-like domain protein  26.32 
 
 
230 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  38.36 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1343  glutaredoxin-like domain-containing protein  34.67 
 
 
249 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000875988  normal  0.962499 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1145  glutaredoxin  30.26 
 
 
100 aa  42.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0311964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  32.05 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  36.36 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  32.05 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  29.73 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  33.33 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  35.44 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  32.93 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  35.14 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  37.04 
 
 
107 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  32.47 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  35.9 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  35.44 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  35.44 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  35.44 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  35.62 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  32 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  35.44 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  35.62 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  36.99 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  32.05 
 
 
104 aa  42  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  35.48 
 
 
110 aa  42  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  32.93 
 
 
107 aa  42  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1507  glutaredoxin-like domain-containing protein  32.56 
 
 
250 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.499765  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  33.77 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  35.44 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  36 
 
 
108 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  35.62 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51357  thioredoxin m  32.91 
 
 
200 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  30.86 
 
 
104 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  34.25 
 
 
109 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  29.33 
 
 
107 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>