70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1762 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  321  3e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  91.82 
 
 
158 aa  289  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  90.57 
 
 
158 aa  285  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  72.33 
 
 
159 aa  230  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  54.32 
 
 
162 aa  185  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  40.99 
 
 
178 aa  102  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 
172 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  31.98 
 
 
173 aa  99  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  30.73 
 
 
181 aa  94.7  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  36.75 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 
177 aa  87  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  35.84 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  31.9 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  34.15 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  35.22 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  29.28 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  29.32 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  24.29 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  29.27 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  26.42 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  29.92 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  32.12 
 
 
134 aa  58.5  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.09 
 
 
203 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35190  DNA-binding protein  44 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
204 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
208 aa  43.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  36.84 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  36.84 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  36.84 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 
300 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  36.84 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  36.84 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  36.84 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  36.84 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
212 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  36.84 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1572  transcriptional regulator, XRE family  21.51 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  26.51 
 
 
325 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 
191 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 
279 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
197 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 
411 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
252 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 
371 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  35.71 
 
 
186 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 
135 aa  41.6  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  33.93 
 
 
186 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1157  DNA binding domain-containing protein  28.03 
 
 
174 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0872862  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 
205 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>