More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1758 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  100 
 
 
260 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1021  NifC-like ABC-type porter  98.85 
 
 
260 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0923  NifC-like ABC-type porter  97.31 
 
 
260 aa  455  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1306  molybdate ABC transporter, permease protein  63.32 
 
 
268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2783  ABC-type transport systems, permease component  53.63 
 
 
261 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000474953  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1820  NifC-like ABC-type porter  54.18 
 
 
261 aa  256  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0980695  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  43.46 
 
 
270 aa  239  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  45.3 
 
 
263 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  45.61 
 
 
264 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  45.33 
 
 
265 aa  205  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1583  NifC-like ABC-type porter  44.53 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.583953  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  38.84 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  38.43 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  38.11 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  43.13 
 
 
266 aa  179  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
274 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000227965  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3448  NifC-like ABC-type porter  41.03 
 
 
269 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2207  NifC-like ABC-type porter  42.66 
 
 
272 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  37.28 
 
 
270 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  36.25 
 
 
273 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632399  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  37.32 
 
 
288 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
258 aa  135  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.27 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.54 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  34.03 
 
 
277 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  30.96 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.6 
 
 
282 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1376  sulfate ABC transporter permease protein CysT  34.42 
 
 
282 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.16 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.79 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4653  sulfate ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4317  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.68 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.77 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.8 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  36.82 
 
 
278 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0611  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.88 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.38 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.87 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.05 
 
 
273 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.33 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.84 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.84 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.96 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.84 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.01 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.54 
 
 
293 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.45 
 
 
275 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.2 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.86 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.47 
 
 
308 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3456  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.33 
 
 
277 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.421678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.86 
 
 
308 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.9 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.58 
 
 
273 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.1 
 
 
284 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  33.2 
 
 
270 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  35.27 
 
 
271 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.12 
 
 
291 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02517  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.8 
 
 
270 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.15 
 
 
288 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02324  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.52 
 
 
277 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 
223 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  33.15 
 
 
288 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1255  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.52 
 
 
277 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3860  sulfate/molybdate ABC transporter inner membrane protein  33.06 
 
 
277 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.384915  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02285  hypothetical protein  32.52 
 
 
277 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4180  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.06 
 
 
277 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456448  normal  0.122933 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2560  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.52 
 
 
277 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.96 
 
 
285 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.59 
 
 
278 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3756  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.49 
 
 
277 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1237  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
277 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2796  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.33 
 
 
277 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2703  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.8 
 
 
277 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224931  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2579  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.33 
 
 
277 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2679  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.8 
 
 
277 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.51 
 
 
285 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2710  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.33 
 
 
277 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2637  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.8 
 
 
277 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2809  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.8 
 
 
277 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3654  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.33 
 
 
277 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2588  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.8 
 
 
277 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  35.63 
 
 
279 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  39.06 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.67 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0732  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.95 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2950  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.33 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.529327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1012  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  37.29 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0793  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.28 
 
 
279 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1197  sulfate ABC transporter, permease protein  35.45 
 
 
275 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.94 
 
 
279 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2532  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.09 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000130184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4343  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.33 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.279119  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3401  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.12 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>