More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1712 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1712  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  100 
 
 		 418 aa  857    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0977  nickel-dependent hydrogenase large subunit  99.04 
 
 		 418 aa  852    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.390644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1215  nickel-dependent hydrogenase large subunit  79.9 
 
 		 418 aa  723    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0996  nickel-dependent hydrogenase large subunit  85.17 
 
 		 418 aa  758    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0969  nickel-dependent hydrogenase large subunit  97.85 
 
 		 418 aa  846    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_553  nickel-dependent hydrogenase, group 3, large subunit  47.07 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0139726  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0588  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  46.6 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204108  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0615  hydrogenase, group 3, VhuA subunit, putative  47.07 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3954  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  48.72 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0652  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  45.48 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0070  nickel-dependent hydrogenase large subunit  45 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1791  hydrogen dehydrogenase  48 
 
 		 449 aa  395  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0078  nickel-dependent hydrogenase large subunit  46.86 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0097  nickel-dependent hydrogenase large subunit  46.08 
 
 		 475 aa  391  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.325648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3537  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  45.54 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1651  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  45.94 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2476  nickel-dependent hydrogenase large subunit  42.75 
 
 		 473 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.795621  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2013  nickel-dependent hydrogenase large subunit  44.91 
 
 		 487 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2102  nickel-dependent hydrogenase large subunit  44.36 
 
 		 472 aa  356  5e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.782605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4160  nickel-dependent hydrogenase large subunit  42.37 
 
 		 474 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2221  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  42.96 
 
 		 482 aa  349  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.794889  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0114  NAD-reducing hydrogenase, beta subunit  42.69 
 
 		 494 aa  348  7e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1459  nickel-dependent hydrogenase large subunit  42.82 
 
 		 504 aa  348  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.720227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0092  nickel-dependent hydrogenase large subunit  41.89 
 
 		 474 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1007  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  42.45 
 
 		 455 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0095  nickel-dependent hydrogenase large subunit  41.89 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4661  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  41.84 
 
 		 487 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1673  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  42.07 
 
 		 493 aa  343  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.521628  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0531  putative nickel-dependent hydrogenase, large subunit  42.31 
 
 		 504 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4043  nickel-dependent hydrogenase large subunit  41.25 
 
 		 473 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0198059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2250  nickel-dependent hydrogenase large subunit  41.63 
 
 		 488 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0169608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3855  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  43.06 
 
 		 507 aa  335  7e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3539  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  42.37 
 
 		 474 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0982  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  42.58 
 
 		 487 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1215  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  41.06 
 
 		 499 aa  332  6e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2748  nickel-dependent hydrogenase large subunit  42.89 
 
 		 488 aa  332  9e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2258  nickel-dependent hydrogenase large subunit  40.23 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2555  NAD-reducing hydrogenase HoxS beta subunit  39.81 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3680  nickel-dependent hydrogenase large subunit  40.79 
 
 		 509 aa  323  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0782936  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1368  nickel-dependent hydrogenase large subunit  42.03 
 
 		 475 aa  318  9e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2791  nickel-dependent hydrogenase large subunit  40.38 
 
 		 482 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.119602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1525  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  39.53 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000894187  hitchhiker  0.00486844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2716  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  40.53 
 
 		 479 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4113  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  39.02 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509028  normal  0.183384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3320  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  41.39 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1113  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  37.86 
 
 		 476 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.301961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4314  nickel-dependent hydrogenase large subunit  36.19 
 
 		 494 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4292  nickel-dependent hydrogenase large subunit  36.19 
 
 		 494 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3972  nickel-dependent hydrogenase large subunit  39.37 
 
 		 473 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000529156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2718  NAD-reducing hydrogenase, beta subunit  37.71 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2419  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  41.39 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.954862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3884  nickel-dependent hydrogenase large subunit  38.89 
 
 		 473 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1553  nickel-dependent hydrogenase large subunit  38.04 
 
 		 479 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4162  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  35.16 
 
 		 494 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0906302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4306  nickel-dependent hydrogenase large subunit  33.79 
 
 		 498 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891144  normal  0.552071 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2132  nickel-dependent hydrogenase large subunit  33.01 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0448433  normal  0.0283043 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2605  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.58 
 
 		 439 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0537031  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1256  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.02 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2097  nickel-dependent hydrogenase large subunit  31.69 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2169  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  31.3 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1929  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.45 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0080  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.38 
 
 		 421 aa  159  7e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.303597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1122  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  30.66 
 
 		 425 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1045  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.78 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0884  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.12 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.912975  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2499  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.69 
 
 		 424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0507  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.33 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2660  Coenzyme F420 hydrogenase  28.33 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.041142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0015  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  30.61 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0692  nickel-dependent hydrogenase large subunit  31.15 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2590  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.7 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282401  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0196  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  30.44 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2387  hypothetical protein  27.33 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1291  coenzyme F420 hydrogenase, subunit alpha  30.07 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333817  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0245  hydrogenase/sulfur reductase, alpha subunit  27.51 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392685  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0937  [NiFe] hydrogenase, alpha subunit, putative  28.19 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1055  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.43 
 
 		 432 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3416  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.99 
 
 		 430 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291194  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3427  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.99 
 
 		 430 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3479  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.99 
 
 		 430 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.441341  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0627  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.21 
 
 		 390 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.931032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2287  coenzyme F420 hydrogenase, subunit alpha  28.7 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.304616 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1231  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.54 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1019  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.4 
 
 		 431 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653003 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2532  hypothetical protein  26.44 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0073  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.18 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0649  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  29.93 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0452  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  28.48 
 
 		 456 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1858  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.36 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2174  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  29.71 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1969  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.9 
 
 		 514 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.668451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1138  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.63 
 
 		 431 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0084  coenzyme F420 hydrogenase, subunit alpha  28.19 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0042117  normal  0.0638209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04400  Soluble nickel-dependent hydrogenase, large subunit, HoxH  27.29 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1248  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  29.34 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.210122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1263  hypothetical protein  26.6 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.321319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4496  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.7 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.401222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4826  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.74 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.106762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1968  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.93 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2249  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.61 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>