123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1646 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1646  GTP cyclohydrolase  100 
 
 
315 aa  640    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.333029  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0915  GTP cyclohydrolase  97.14 
 
 
315 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.599141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1031  GTP cyclohydrolase  94.92 
 
 
315 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59743  hitchhiker  0.00756508 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1031  GTP cyclohydrolase  89.35 
 
 
312 aa  555  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.489752  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1148  GTP cyclohydrolase  75.88 
 
 
309 aa  477  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.713445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  49.35 
 
 
317 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0480  GTP cyclohydrolase  49.35 
 
 
326 aa  306  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  49.68 
 
 
319 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0018  GTP cyclohydrolase  47.91 
 
 
311 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0054  GTP cyclohydrolase  49.35 
 
 
317 aa  294  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0355  GTP cyclohydrolase  50.81 
 
 
322 aa  293  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.498467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  44.27 
 
 
313 aa  292  6e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  47.71 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1583  GTP cyclohydrolase  43.04 
 
 
309 aa  253  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  46.53 
 
 
290 aa  251  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0488  protein of unknown function DUF198  41.75 
 
 
310 aa  250  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2853  protein of unknown function DUF198  41.42 
 
 
310 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  39.48 
 
 
309 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2260  GTP cyclohydrolase  39.35 
 
 
340 aa  238  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  39.62 
 
 
333 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0579  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  37.91 
 
 
480 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  28.57 
 
 
267 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  30.69 
 
 
259 aa  106  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  28.23 
 
 
267 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  27.3 
 
 
258 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  26.78 
 
 
261 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  27.76 
 
 
259 aa  99.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  27.09 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  27.99 
 
 
274 aa  96.3  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  27.72 
 
 
267 aa  95.9  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  27.45 
 
 
266 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  29.28 
 
 
266 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  27.85 
 
 
260 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  28.62 
 
 
257 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  27.95 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  30.2 
 
 
259 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  27.65 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  26.89 
 
 
273 aa  90.1  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  28.39 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  29.83 
 
 
259 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  25.51 
 
 
276 aa  89.7  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  25.59 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  29.14 
 
 
266 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  27.7 
 
 
260 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  25.34 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  26.73 
 
 
259 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  27.03 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  26.01 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  27.92 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  27.15 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  27.09 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  27.85 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  25.34 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  27.09 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  27.3 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  26.32 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  27.76 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  27.95 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1269  protein of unknown function DUF198  28.19 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000812404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  28.62 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  27.39 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  26.19 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  27.42 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  26.6 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  26.6 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  25.34 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  26.42 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  26.42 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  27.18 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  27.33 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  27.33 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  26.69 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  27 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  26.76 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  26.76 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  26.76 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  27 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  29.29 
 
 
261 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  26.01 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  26.53 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4498  putative GTP cyclohydrolase  23.38 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29210  putative GTP cyclohydrolase  25.56 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00695  putative GTP cyclohydrolase  26.2 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24848  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  24.58 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2578  hypothetical protein  25.38 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176733  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1875  putative GTP cyclohydrolase  23.36 
 
 
315 aa  62.8  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  24.04 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  22.15 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  22.15 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  23.55 
 
 
367 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  26.5 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>